Я могу снять её с РУ так как я новый собственник, а зарегистрировал её бывший собственник?

необходимо смотреть как она была зарегистрирована, в качестве кого. Если как член семьи бывшей собственницы квартиры , то на основании п. 2 ст. 292 ГК РФ подавайте иск в суд о признании ее утратившей право пользования квартирой, как члена семьи бывшего собственника.

Евгений, в соответствии со ст. 31 Жилищного кодекса к членам семьи собственника жилого помещения относятся проживающие совместно с данным собственником в принадлежащем ему жилом помещении его супруг, а также дети и родители данного собственника. Другие родственники, нетрудоспособные иждивенцы и в исключительных случаях иные граждане могут быть признаны членами семьи собственника, если они вселены собственником в качестве членов своей семьи. В случае прекращения семейных отношений с собственником жилого помещения право пользования данным жилым помещением за бывшим членом семьи собственника этого жилого помещения не сохраняется, если иное не установлено соглашением между собственником и бывшим членом его семьи. Так как ваша БЖ была вселена в вашу квартиру в качестве члена вашей семьи (гражданской жены), а теперь является "бывшим членом семьи собственника", то вы имеете полное право требовать через суд о признании ее утратившей право пользования жилым помещением и здесь не имеет значение, что регистрировал ее бывший собственник, поскольку теперь вы являетесь единственнм владельцем данной квартиры.