Как обезопасить себя от негативных действий работодателя и защитить переработку в объяснительной записке?

Дополнительный вопрос к ранее озвученному вопросу - http://www.9111.ru/questions/q1388965.html#q1388965

Ранее я озвучивал, что пытаюсь урегулировать вопрос моего увольнения по соглашению сторон с работодателем с включением в пункта о материальной компенсации. Одним из пунктов моего предыдущего вопроса было - как обезопасить себя от возможных негативных действий со стороны работодателя?

К сожалению, работодатель пошел по этому пути...

Сегодня работодатель прислал график прихода/ухода на работу в котором отмечены мои опоздания за последний месяц с просьбой написать по ним объяснительные записки.

При этом в теле письма есть фраза о том, что формально я должен являться на работу (работа находится достаточно далеко от моего дома - автобус 2 остановки, метро с двумя пересадками, трамвай - 1 остановка) строго к 9-00 и уходить не раньше 18-00.

В графике у меня есть несколько опозданий на 5-20 мин и есть показания о том, что несколько раз перерабатывал. Последнее в сумме, по-моему, перекрывает все мои опоздания на работу.

Одно опоздание на 1 час было вызвано сбоем движения поездов метро. Три дня - пропущены по болезни.

Работодатель сообщает, что его не интересуют мои переработки. Формально с его слов я не нагружен работой и должен все уметь успевать во время.

Ранее мне были даны рекомендации: Просто работать добросовестно и все рабочее время.

Тем не менее я вижу риски после составления объяснительной записки и не согласен, что переработка не должна защитываться, как суммарное рабочее время.