Истек ли срок подачи заявления о судебных расходах ответчика в случае отсутствия определения суда в связи с неявкой истца?

Считать срок нужно со дня вступления определения в законную силу, а не со дня вручения определения. В вашем случае неясно, когда оно вступило в силу. В любом случае, я думаю что срок истек, поскольку даже если определение вступило в силу где нибудь в апреле-мае, то уже поздно. Здесь проблема в другом: суд не восстановил срок. Так что можно попробовать обжаловать отказ, хотя даже в условиях ограничительных мер никто не мешал подать заявление о возмещении судебных расходов по почте.

Определение об оставлении дела без рассмотрения в связи с повторной неявкой истца оглашено 15.01.2020, ответчик присутствовал на заседании. Но определение не выдано ответчику сразу, а только 02.03.2020. Когда истек срок подачи заявления о судебных расходах ответчика 15.04.2020 или 02.06.2020? Заявление о возмещении судебных расходов отправлено 26.04.2020 по почте России. Ходатайство о восстановлении пропущенного срока в связи с введением ограничительных мер в условиях распространения новой коронавирусной инфекции подано по электронным каналам 02.07.2020. Судья отказала в связи с пропуском срока подачи, так как "раз была возможность подать 26.04.2020 и 02.07.2020, то и ранее такая возможность у ответчика была".

В определении об оставлении дела без рассмотрения вообще ничего не написано, когда оно вступает в силу. Написано, что оно может быть отменено по заявлению истца, если он представит доказательства, что не мог присутствовать.