Если я не прошел медика на предприятии на сколько могут лишить премии.

Зависит от положения об оплате труда Вашего работодателя, смотрите его. Но, по тексту - Вас имеют право отстранить (ст. 76 ТК РФ), а в этот период зарплата вообще не платится.