Как поступить, если обнаружены недоделки на приёмке квартиры в новостройке?

Нужно соблюдать последовательность. Раз уже вы подали претензию, то ждите 45 суток, а потом подавайте в суд.

Исходя из практики споров с Застройщиками, Вам лучше дождаться устранения недоделок (это не всегда с первого раза происходит, бывает 2-3 раза по 45 дней), а потом требовать в суде компенсации за нарушение сроков сдачи объекта.

Судиться по некачественному ремонту Вы замучаетесь: сначала Вам нужно будет независимую строительно-техническую экспертизу сделать, после подачи иска до основного заседания пройдёт 2-3 месяца, затем застройщик принесёт свои документы, что квартира в порядке, будет назначена судебная строительно-техническая экспертиза (которую сначала оплачиваете Вы, с ответчика взыщут позже, если иск удовлетворять) - это ещё примерно 2-3 месяца до вынесения решения. Обжалование решения - ещё 2-3 месяца. При этом, если Вы подпишите акт приема-передачи, суд может посчитать, что Вы согласились принять квартиру в таком состоянии. Важно правильно составить до судебную претензию и отправить её до подписания акта (это относится и к взысканию неустойки за нарушение сроков). В целом, суды по ремонту очень затратные, а результат не оправдывает ожиданий: судебный эксперт оценивает качество по минимально допустимым стандартам, и расчёт стоимости ремонта, соответственно, почти по самым дешевым материалам.

Влад, но откуда Вы можете знать, что в эти 45 дней недостатки не устранят?

Ждите и далее по ситуации.