Имеет ли компания право брать сотрудника по договору возмездного оказания услуг, если его принимают на постоянную работу?

У меня появился такой вопрос. Пожалуйста, ответьте, мне необходимо срочно принять какие-либо меры! Я начала работать в организации 12 месяцев назад. При приеме на работу мне сказали, что меня ожидает испытательный срок 3 месяца и по истечении испытательного срока меня берут в штат с записью в трудовой книжке (что уже похоже на нарушение ТК). В результате, испытательный срок прошел, мною были довольны, но запись в трудовой книжке сделали спустя 4 месяца, а не 3, как обещали. Как оказалось, все 4 месяца я работала по договору возмездного оказания услуг. Теперь сложилась такая ситуация – меня уволили из этой организации в связи с переводом в другую (рост внутри компании, но у разных подразделений 2 юридических лица). И насчитали, что я «перегуляла отпуск», который в итоге составил 21 день (а не 28, я ведь фактически я отработала 12 месяцев), объяснив это тем, что первые 4 месяца не входят в тот срок, по которому начисляется отпуск из-за того договора, по которому я работала 4 месяца. Итак, фактически я проработала в компании год, была в отпуске 21 день, но должна выплатить компании деньги за 4 лишних дня отпуска? Верно ли это? Имеет ли компания право брать сотрудника по договору возмездного оказания услуг, если его принимают на постоянную работу? Если нет, что Вы посоветуете сделать, чтобы все было по закону. Спасибо.