Американские вирусологи объясняют, почему штаммы Omicron представляют серьезную угрозу

Треш Кучипуди (клинический профессор Пенсильванского государственного университета)

Исследователи в Южной Африке 24 ноября объявили об обнаружении нового мутанта нового коронавируса. Два дня спустя ВОЗ (Всемирная организация здравоохранения) назвала вариант Омикрон и обозначила его как «вариант, вызывающий озабоченность».

Количество мутаций, содержащихся в штамме Омикрон, составляет 50, что намного больше, чем у обычного мутантного штамма (9 в штамме Дельта).

Более того, 32 из них сосредоточены в песпломере, выпячивании, используемом при внедрении вируса в клетки хозяина.

Все три вакцины, используемые в настоящее время в Соединенных Штатах, предназначены для индукции антител к этому пепломеру, чтобы предотвратить его более тяжелое течение.

Большое количество мутаций в штамме Омикрон может означать, что он очень заразен и/или способен уклоняться от иммунной защиты хозяина. Это очень тревожный вопрос.

Автор — вирусолог, изучающий, как новые инфекционные заболевания и вирусы, вызывающие пандемии, возникают в новых вирусах и зоонозных вирусах.

Мы также изучили различные аспекты нового коронавируса, в том числе инфекции животных.

Удивительно большое количество мутаций, содержащихся в штамме Омикрон, но появление новых мутантов вовсе не удивительно.

Случайные мутации накапливаются в любом вирусе путем естественного отбора, но РНК-вирусы, такие как новый коронавирус, действуют быстрее, чем ДНК-вирусы. Если комбинация мутаций способствует выживанию по сравнению с обычным мутантом, новый мутант заменяет существующий мутант.

Так являются ли штаммы Omicron более опасными и заразными, чем штаммы Delta?

Я этого еще не знаю. Условия, при которых появился штамм Омикрон, пока не ясны.

В целом мутантные штаммы с множественными мутациями чаще появляются у больных с ослабленным иммунитетом и длительной инфекцией. Вирусы имеют тенденцию быстро развиваться в этих средах.

Фактически, эксперты подозревают, что таким образом могли возникнуть ранние варианты нового коронавируса, такие как штамм альфа.

Однако количество и структура мутаций, содержащихся в штамме Омикрон, явно отличается от таковой у предыдущих мутантных штаммов. В связи с этим возникает вопрос, откуда оно взялось

Одной из возможных возможностей является появление из животного-хозяина. Было показано, что новый коронавирус заражает таких животных, как норки, тигры, львы, собаки и кошки.

Исследовательская группа во главе с автором недавно сообщила, что белохвостые олени в Соединенных Штатах были заражены широким спектром новых коронавирусов, хотя еще не прошли рецензирование.

Поэтому нельзя исключать возможность того, что вирус быстро развился в организме животного-хозяина и появился штамм Omicron.

Штамм Delta в 1,4–1,6 раза более заразен, чем штамм Alpha, и примерно в два раза более заразен, чем исходный штамм. Эксперты считают, что Дельта стал доминирующим мутантом в конкуренции с другими мутантами.

Другим важным фактором победы варианта над естественным отбором является скорость его репликации (насколько быстро вы можете создать собственную копию).

Штамм Delta имеет более высокую скорость самовоспроизведения, чем предыдущие мутантные штаммы. Считается, что это связано с тем, что дельта-штамм стал более эффективно связываться с белком-рецептором ACE2-хозяина за счет мутации шиповидного белка.

Штамм Delta также приобрел мутации, которые избегают нейтрализующих антител, играющих решающую роль в защите хозяина от вируса.

Таким образом, существующие вакцины могут быть немного менее эффективными против штаммов Delta.

Сильное сочетание высокой инфекционности и антииммунитета может быть причиной столь быстрого распространения штамма Delta.

Более того, многие исследования показывают, что люди, инфицированные штаммом Delta, подвергаются более высокому риску госпитализации, чем инфицированные исходным штаммом или ранними вариантными штаммами.

Считается, что это связано с тем, что мутация в спайковом белке (мутация P681R) увеличила способность вируса проникать в клетку-хозяин и вызывать обострение.

В настоящее время неизвестно, будет ли штамм Omicron иметь более жизнеспособную структуру, чем штамм Delta, и станет ли он новым доминирующим вариантом.

Омикрон имеет некоторые из тех же мутаций, что и Дельта, но также и очень разные мутации.

Однако одна из причин, по которой исследовательское сообщество сейчас вызывает особую озабоченность, заключается в том, что штамм Omicron находится в рецептор-связывающем домене (область, где шиповидный белок связывается с ACE2 и опосредует инвазию в клетку-хозяина) Он имеет 10 мутаций. . Было две акции Delta.

Если он более заразен и антигенен, чем штамм Дельта, вполне вероятно, что штамм Омикрон распространится по всему миру.

С другой стороны, включение многих мутаций отрицательно сказывается на самом вирусе и может быть менее стабильным как вирус, чем обычные штаммы.

Омикрон — не последний вариант нового коронавируса, и весьма вероятно, что он продолжит появляться в будущем. По мере распространения инфекции естественный отбор и адаптация будут повторяться, и появится больше мутантных штаммов с более высокой инфекционностью, чем штамм Дельта.

Из вируса гриппа мы узнали, что процесс адаптации вируса никогда не заканчивается.

Низкие показатели вакцинации во многих странах мира означают, что все еще существует большое количество уязвимых носителей нового коронавируса.

И пока инфекция может распространяться, вирус будет распространяться и мутировать много раз.

В этом смысле появление штамма Омикрон напоминает нам о том, что глобальная вакцинация является неотложной задачей для дальнейшего распространения и предотвращения эволюции вируса.

источник: