Суперкомпьютер обнаружил 110 тыс. новых вирусов. В том числе девять ранее неизвестных коронавирусов

Анализ почти 6 миллионов биологических образцов выявил более 110 000 новых вирусов, в том числе девять неизвестных до сих пор коронавирусов. Удивительное открытие может быть использовано для отслеживания потенциальных будущих пандемий.

Более 110 тыс. новые вирусы обнаружены благодаря суперкомпьютеру

Исследование, результаты которого только что появились в престижном научном журнале „Природа”, возникло как „забавный побочный проект”, – признается ведущий автор доктор Артем Бабаян. Международная команда ученых просто хотела проверить возможности нового суперкомпьютера. Для этого он предоставил ему около 20 миллионов гигабайт данных, содержащих секвенированные гены из 5,7 миллионов биологических образцов, собранных в различных средах – от ледниковых ядер до животных экскрементов.

Суперкомпьютер, используемый в исследованиях, имеет вычислительную мощность 22 500 типичных процессоров. Выполнение анализа, который традиционному суперкомпьютеру занял бы более года (и стоил бы сотни тысяч долларов), современному оборудованию потребовалось всего 11 дней и стоило 24 тыс. долларов. И полученные результаты не только вышли далеко за рамки побочного проекта, но и оказались важным открытием.

Новые вирусы помогут отследить источник пандемии

Компьютер проанализировал данные и обнаружил 132 000 РНК-вирусов (к этой группе относятся m.in. вирус гепатита С или вирус RSV), из которых только 15 000 были ранее известны науке. Среди выявленных компьютером "новинок" оказались и девять новых коронавирусов, происходящих, скорее всего, от свиней, птиц и летучих мышей.

Авторы исследования признают, что без дополнительного анализа невозможно определить, могут ли эти недавно обнаруженные коронавирусы заражать людей. Однако они напоминают, что наряду с такими грозными коронавирусами, как SARS-CoV-2 (ответственный за пандемию COVID-19), SARS-CoV и MERS-CoV, известны также четыре, которые обычно вызывают у людей только простуду.

По словам авторов, неожиданный результат исследования может помочь отслеживать и предотвращать будущие вспышки. – Мы вступаем в новую эру понимания генетического разнообразия вирусов в природе и того, насколько разные животные связаны с этими вирусами. Мы надеемся, что мы не будем удивлены, если что-то вроде SARS-CoV – 2 появится снова, - говорит доктор Артем Бабаян.

Появится глобальная база новых вирусов?

Ученые надеются, что на основе их открытия будет создана база информации о вирусах, которая позволит быстро идентифицировать источник данного возбудителя, и таким образом, не только ограничить его распространение, но и в короткие сроки разработать методы лечения или вакцины.

– Если у пациента развивается лихорадка неизвестного происхождения, после секвенирования образца крови можно будет связать этот вирус неизвестного у человека с гораздо большей базой данных вирусов, существующих в природе. Например, если у пациента из Сент – Луиса мы обнаруживаем вирусную инфекцию неизвестного происхождения, в течение двух минут мы можем искать базу данных и связывать этот вирус с, скажем, верблюдом из Африки к югу от Сахары, из которого был получен образец 2012 года, объясняет доктор Бабаян.

Ученые рассчитывают, что инфекции, распознанные очень рано, никогда не перерастут в пандемию. Однако для того, чтобы этот сценарий стал реальностью, необходимо провести профессиональную, передовую диагностику во всех сомнительных случаях. И это может быть проблемой, особенно в слаборазвитых странах.