Оба вируса, обнаруженные у летучих мышей, хранящихся в лабораторных морозильных камерах, являются первыми родственниками SARS-CoV-2, обнаруженными за пределами Китая.
Коронавирус, связанный с SARS-CoV-2, был обнаружен у подковообразных летучих мышей Шамела, пойманных в Камбодже в 2010 году. Фото: Merlin D. Tuttle / SPL
Два лабораторных морозильника в Азии сделали удивительные открытия. Исследователи сообщили Nature, что они обнаружили коронавирус, который тесно связан с SARS-CoV-2, вирусом, ответственным за пандемию, у подковообразных летучих мышей, хранящихся в морозильной камере в Камбодже. Между тем, группа ученых из Японии сообщила об обнаружении еще одного тесно связанного с ним коронавируса, который также обнаружен в замороженном помете летучих мышей.
Вирусы являются первыми известными родственниками SARS-CoV-2, обнаруженными за пределами Китая, что поддерживает поиск Всемирной организацией здравоохранения в Азии животного происхождения пандемии. Имеются убедительные доказательства того, что SARS-CoV-2 возник у подковоносов, но передается ли он напрямую от летучих мышей к людям или через промежуточного хозяина, остается загадкой.
Вирус в Камбодже был обнаружен у двух подковообразных летучих мышей Шамела (Rhinolophus shameli ), пойманных на севере страны в 2010 году. Геном вируса еще не был полностью секвенирован - и его открытие не опубликовано - поэтому его полное значение для пандемии трудно установить.
По словам Висны Дуонг, если вирус очень тесно связан с пандемическим вирусом или даже является его предком, он может предоставить важную информацию о том, как SARS-CoV-2 передается от летучих мышей к людям, и дать информацию для поиска происхождения пандемии. Вирусолог из Института Пастера в Камбодже в Пномпене, который руководил поиском старых образцов в Камбодже и предупредил Nature об открытии в начале ноября. Чтобы получить такое представление, вирус должен иметь более 97% своего генома с SARS-CoV-2, что больше, чем у его ближайшего известного родственника, говорят исследователи.
Но новый вирус может иметь более отдаленное родство, и в этом случае его изучение поможет ученым узнать больше о разнообразии этого семейства вирусов, говорит Этьен Симон-Лорьер, вирусолог из Института Пастера в Париже, который планирует секвенировать вирус. Вирус, после чего он станет общедоступным.
Именно так обстоит дело с другим вирусом, называемого Rc-o319, которые были определен в маленьком японском подковоносе (Rhinolophus Корнут) , захваченный в 2013 году, что вирус акций 81% его генома с SARS-COV-2, согласно бумаге 1 опубликованной 2 ноября, что делает его слишком далеким, чтобы дать представление о происхождении пандемии, говорит Эдвард Холмс, вирусолог из Сиднейского университета в Австралии.
Независимо от того, что обнаружила камбоджийская команда, оба открытия являются захватывающими, потому что они подтверждают, что вирусы, тесно связанные с SARS-CoV-2, относительно часто встречаются у летучих мышей Rhinolophus и даже у летучих мышей, обнаруженных за пределами Китая, - говорит Элис Латин, биолог-эволюционист из Центра дикой природы. Общество охраны природы Вьетнама в Ханое, которое ознакомилось с некоторыми анализами камбоджийской группы, но не участвовало в расследовании.
«Это то, что мы искали, и мы это нашли», - говорит Дуонг. «Это было захватывающе и удивительно одновременно».
Истоки пандемии
Полученные данные также предполагают, что другие еще не обнаруженные родственники SARS-CoV-2 могут храниться в лабораторных морозильных камерах, говорит Аарон Ирвинг, исследователь инфекционных заболеваний из Чжэцзянского университета в Хайнине, Китай, который также планирует протестировать хранящиеся образцы летучих мышей и летучих мышей. Другие млекопитающие на антитела против SARS-CoV-2.
«Я не ожидал найти родственника SARS-CoV-2», - говорит вирусолог Шин Мураками из Токийского университета, входивший в команду, которая решила повторно протестировать замороженные образцы животных на вирусы после пандемии.
Только несколько известных коронавирусов тесно связаны с SARS-CoV-2, включая его ближайшего известного родственника RaTG13. Это было обнаружено у подковоносов среднего размера (Rhinolophus affinis ) в китайской провинции Юньнань в 2013 году и опубликовано 2 только в начале этого года. Есть также несколько других коронавирусов, обнаруженных у других летучих мышей Rhinolophus и ящеров, пойманных в период с 2015 по 2019 год, которые, как теперь известно ученым, тесно связаны с SARS-CoV-2.
«SARS-CoV-2, вероятно, не был совершенно новым вирусом, который появился внезапно. Вирусы в этой группе существовали до того, как мы узнали о них в 2019 году », - говорит Трейси Голдштейн, заместитель директора One Health Institute при Калифорнийском университете в Дэвисе, которая работает с камбоджийской командой.
Латин говорит, что открытия подтверждают, что летучие мыши Rhinolophus являются резервуаром этих вирусов.
Вирус в Камбодже
Команда Дуонга проверила летучих мышей Шамела в Камбодже на наличие коронавирусов в рамках финансируемого правительством США проекта PREDICT, который в течение десятилетий проводил обследование дикой природы во всем мире на наличие вирусов с пандемическим потенциалом и завершился в начале этого года. Группа, в которую вошли исследователи из Французского национального музея естественной истории в Париже и Института Пастера в Камбодже, первоначально собрала летучих мышей в 2010 году.
В апреле Агентство США по международному развитию выделило программе дополнительные 3 миллиона долларов США и продление на 6 месяцев для поиска доказательств SARS-CoV-2 в образцах животных - в основном летучих мышей, а также ящеров и других животных, которые были обнаружены. Сидя в морозильных камерах лабораторий в Лаосе, Малайзии, Непале, Таиланде, Вьетнаме и Камбодже. Полный отчет об этих расследованиях ожидается в ближайшие недели.
Дуонг говорит, что предварительное секвенирование генома короткого фрагмента нового вируса летучих мышей - длиной 324 пары оснований - показало, что он был похож на тот же участок в SARS-CoV-2 и RaTG-13, предполагая, что эти три тесно связаны. По словам Латинна, этот регион очень консервативен у коронавирусов и часто используется для быстрого определения того, является ли вирус новым или известным. Но пока не ясно, является ли RaTG-13 или новый вирус более тесно связанным с SARS-CoV-2.
С таким маленьким фрагментом трудно сказать, - говорит Вибол Хул, вирусолог из Института Пастера в Камбодже, который был частью команды, которая поймала летучих мышей Шамеля у входа в пещеру в 2010 году. Геномы большинства известные коронавирусы содержат около 30 000 пар оснований.
В отдельном анализе команда из Камбоджи секвенировала около 70% генома нового вируса с использованием технологии, доступной на местном уровне, - говорит Эрик Карлссон, вирусолог из Института Пастера в Камбодже, который помогал анализировать летучих мышей. В этой последовательности отсутствовали инструкции для важнейших частей вируса, таких как гены, кодирующие белок-спайк, который коронавирусы обычно используют для проникновения в клетки. Секвенирование этого раздела покажет, может ли этот вирус инфицировать человеческие клетки, говорит Дуонг.
По словам Ирвинга, новый вирус должен быть как минимум на 99% похож на SARS-CoV-2, чтобы быть непосредственным предком нынешнего пандемического вируса. Геномы RaTG13 и SARS-CoV-2 различаются всего на 4%, но это расхождение представляет собой от 40 до 70 лет эволюции, поскольку у них был общий предок. Хотя между ними существуют десятилетия, вирусы достаточно похожи, чтобы использовать один и тот же рецептор для проникновения в клетки. Клеточные исследования показывают, что RaTG13 может инфицировать людей 3.
Другой близкий родственник
По словам Дуонга, из известных коронавирусов, связанных с SARS-CoV-2, недавно обнаруженный Rc-o319, по-видимому, является наиболее отдаленным родственником.
В исследованиях клеток японская команда обнаружила, что вирус не может связываться с рецептором, который SARS-CoV-2 использует для проникновения в человеческие клетки, предполагая, что он не может легко заразить людей.
Шин говорит, что его коллеги поймали больше летучих мышей в Японии в начале этого года и планируют проверить их на коронавирусы. А в октябре Хул вернулся в пещеру на севере Камбоджи, чтобы поймать больше летучих мышей.
По словам Холмса, больше коронавирусов, связанных с SARS-CoV-2, вероятно, существует в популяциях летучих мышей Rhinolophus , которые живут по всему региону. «Надеюсь, один или несколько из них будут настолько тесно связаны с SARS-CoV-2, что мы сможем считать его истинным предком».
источник:
Здравствуйте! Я – работающий пенсионер, ветеран труда с богатым опытом в культуре и педагогике. Пишу, как чувствую, обо всем понемногу. Открыт для общения, мне важны ваши отзывы. Добро пожаловать в мой мир сомнений, радостей и откровений! Верю в силу слова и надеюсь на отклик в ваших сердцах.
