Что внутри южноафриканской лаборатории, которая обнаружила Omicron: что происходит, и какие были на это причины?

Доступ в лабораторию строго ограничен, так как риск случайного заражения просто слишком высок.

Здесь технические специалисты в жужжащих машинах анализируют 18 000 ПЦР-тестов в день, ища признаки коронавируса.

© ЭММАНУЭЛЬ КРОСЕ Медицинский работник берет образец теста на Covid в лабораториях Lancet в Йоханнесбурге. В прошлом месяце лаборатория обнаружила новый, сильно мутировавший вариант вируса Omicron.

Их работа настолько точна, что всего несколько образцов помогли команде обнаружить Omicron - новый вариант вируса, который вызвал глобальные опасения по поводу еще одного всплеска смертельной пандемии.

В белом лабораторном халате и маске Эфтиксия Вардас курирует армию техников, биохимиков и коллег-вирусологов в Йоханнесбурге на одном из крупнейших объектов, управляемых частной фирмой Lancet Laboratories.

Как клинический вирусолог, она работала над такими заболеваниями, как туберкулез и СПИД в течение двух десятилетий.

В начале ноября 22 положительных теста - в основном в столице Претории - привлекли внимание ее команды.

ПЦР-тесты, наиболее часто используемые для выявления Covid-19, работают путем просеивания генетического кода для поиска трех конкретных генов.

Но лаборатория обнаружила, что один из этих генов — ген S — резко исчез из положительных результатов теста.

«Мы поняли, что в наших ПЦР-тестах что-то было по-другому», — сказала она AFP, набросав свое объяснение в блокноте.

«Мы не были полностью уверены, что это такое, был ли это существующий вариант или новый вариант».

-'День и ночь'-

В то время ранее было обнаружено четыре варианта Covid-19, и все они были источником глубокой обеспокоенности: Delta, которая к тому времени стояла за большинством случаев в мире, Alpha, Beta и Gamma.

Команда Вардаса терпеливо работала, чтобы убедиться, что они не побьют ложную тревогу.

«Нам потребовалось около недели, чтобы накопить образцы, а затем еще одна неделя, чтобы сделать секвенирование», - сказала она. «Тогда мы были уверены, что что-то происходит».

Секвенирование является дорогостоящим и трудоемким процессом, который позволяет ученым раскрыть геном вируса.

«Это показало, что это был совершенно другой вирус», — сказала она. «И это было открытие Омикрона».

Нет никакой радости в том, чтобы обнаружить следующую фазу эпидемии, которая заразила более трех миллионов южноафриканцев, в результате чего 90 000 человек умерли.

Она направила образцы органам здравоохранения в Национальный институт инфекционных заболеваний и KRISP, центр генетических исследований мирового класса в стране.

По мере того, как они углублялись в результаты, они подтвердили, что новый вариант с необычным количеством мутаций вытеснил Delta среди новых случаев.

-Волна страха-

25 ноября вирусолог, получивший известность за идентификацию бета-варианта годом ранее, Тулио де Оливейра, подтвердил на пресс-конференции, что новый вариант был обнаружен.

Это вызвало новую волну страха по поводу пандемии, которая уже убила около 5,2 миллиона человек с тех пор, как первый случай появился в Ухане, Китай, в конце 2019 года.

В течение нескольких часов страны Европы и других стран отреагировали, немедленно введя ограничения на поездки в Южную Африку, что вызвало возмущенные протесты о том, что страна стала козлом отпущения.

Министр здравоохранения Джо Фаахла сказал, что многие граждане считают, что если бы Южная Африка «хранила молчание, запретов на поездки не было бы».

«Но это было бы вредно, потому что наш подход заключается в том, чтобы наши граждане не жили в ложной безопасности и ложной безопасности», - сказал он.

Следующий шаг для ученых в Южной Африке и других странах, чтобы расшифровать, что означают генетические изменения, наблюдаемые в Omicron.

Ранние данные свидетельствуют о том, что вариант более заразен, представляя повышенный риск заражения для людей, которые уже имели вирус или были вакцинированы по сравнению с предыдущими вариантами, но также мягче по своим симптомам, заявил в среду глава Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ) Тедрос Адханом Гебрейесус.

Источник