Новый генетический анализ находит ключ к разгадке животного происхождения вспышки COVID
В пятницу Всемирная организация здравоохранения призвала китайские органы здравоохранения опубликовать генетические последовательности SARS-CoV-2, которые недавно исчезли из международной базы данных после того, как анализ данных показал, что они предлагают новые подсказки, которые могут указывать на животное происхождение COVID-19. 19 пандемия.
Призыв прозвучал после того, как группа ученых за пределами Китая проанализировала генетические последовательности вирусов SARS-CoV-2, которые были первоначально опубликованы в конце прошлого месяца в базе данных Глобальной инициативы по обмену данными о птичьем гриппе (GISAID) Китайским центром по контролю и профилактике заболеваний. База данных представляет собой сайт, на котором ученые со всего мира могут получить доступ к генетическому секвенированию и другим данным и обмениваться ими.
Данные были получены из образцов, взятых в начале 2020 года на рынке животных Хуанань в Ухане, который в ходе расследования, проведенного властями США и Китая, был указан как потенциальный ранний эпицентр вспышки.
Анализ этих образцов обнаружил «молекулярные доказательства» того, что животные, такие как енотовидные собаки на рынке, смешались с мазками из тех же мест, которые выявили выделение самого вируса на рынке.
Енотовидные собаки — это вид, восприимчивый к инфекции SARS-CoV-2, который потенциально мог служить промежуточным хозяином, перенося вирус от летучих мышей или другого источника к людям. Однако образцы указывают только на то, что на рынке присутствовали и енотовидные собаки, и вирус; это не прямое доказательство того, что этот вид был носителем.

«Мы должны четко указать, что вирус не был идентифицирован ни у животного на рынке, ни в образцах животных с рынка, и при этом мы на самом деле не обнаружили животных, заразивших людей. Это дает подсказки. Мы понимаем, что могло произойти», — сообщила журналистам в пятницу Мария Ван Керхове из ВОЗ.
Эти новые данные вызвали встречу во вторник Научно-консультативной группы ВОЗ по происхождению новых патогенов, на которой международные ученые представили свой анализ, а также с китайскими исследователями CDC, которые первоначально опубликовали данные.
Непонятно, почему записи исчезли из базы данных GISAID после того, как они были опубликованы в прошлом месяце, или почему китайские исследователи ждали три года, чтобы опубликовать данные.
Первоначально данные были опубликованы китайскими исследователями в рамках работы над публикацией, первоначально выпущенной в прошлом году в виде препринта.
Исследователи из CDC Китая в прошлом году выпустили препринт, который в настоящее время находится «на рассмотрении», в котором сделан вывод о том, что рынок Хуанань «мог действовать как усилитель» для распространения вируса, занесенного на рынок людьми.
«GISAID сообщил нам, что данные Центра контроля заболеваний Китая обновляются и расширяются. Но опять же, мы обратились непосредственно к Центру контроля заболеваний Китая, чтобы сделать эти данные доступными в полном объеме. И поэтому это остается абсолютно фундаментальным», — сказал Ван Керхове.
Джордж Гао, ведущий автор препринта и бывший глава китайского CDC, преуменьшил значение нового анализа для журнала Science . Гао сказал, что «было известно о незаконной торговле животными, поэтому рынок был немедленно закрыт».
Гао отказался комментировать CBS News, почему последовательности были первоначально опубликованы, а затем исчезли, отложив комментарий для GISAID.
GISAID в своем заявлении отрицал, что они удаляют записи из своей базы данных. Данные «время от времени могут становиться временно невидимыми», когда необходимы исправления для улучшения или исправления данных, сообщает GISAID.
«Чтобы постоянно улучшать качество записей данных, участники часто обновляют свои записи, например, когда становятся доступными последовательности с более высоким разрешением или дополнительные метаданные, или когда требуется проверка», — сказал представитель GISAID в электронном письме.
Также остаются без ответа вопросы о новом анализе, о котором впервые сообщило издание The Atlantic . Например, Ван Керхове отказался указать дополнительные подробности о том, как и какие другие животные были идентифицированы в анализе секвенирования, отложив комментарии исследователей.
Французский ученый Флоренс Дебарр, названная The Atlantic исследователем, который первоначально обнаружил последовательности, не ответила на запрос о комментариях.
В Твиттере Дебарр написал, что они «не планируют сообщать результаты до того, как наш отчет будет закончен. Завершение отчета — мой текущий приоритет».
Но даже если китайские органы здравоохранения повторно опубликуют последовательности, которые они удалили из GISAID, Ван Керхове предупредил, что потребуются гораздо дополнительные исследования, чтобы понять, можно ли окончательно связать происхождение COVID-19 с животными, продаваемыми на рынке.
«Мы неоднократно просили провести исследования на других рынках в Ухане, провинции Хубэй и по всему Китаю. Мы неоднократно просили провести исследования, чтобы проследить этих животных до их исходных ферм, чтобы мы могли вернуться в прошлое и действительно увидеть, откуда взялись животные и проводились ли какие-либо испытания», — сказал Ван Керхове.
Хотя ученые обнаружили доказательства, свидетельствующие о том, что COVID-19, вероятно, имеет зоонозное происхождение — что вирус возник от животных, заразивших людей, подобно предыдущим вирусам — некоторые элементы разведывательного сообщества США пришли к выводу, что вполне вероятно, что пандемия возникла в результате лабораторной аварии.
«Основываясь на моем первоначальном анализе данных, я пришел к выводу, и я продолжаю верить сегодня, что это указывает на то, что COVID-19, скорее всего, был результатом случайной утечки из лаборатории, чем результатом естественного побочного события», — заявила бывшая администрация Трампа. Директор CDC доктор Роберт Редфилд заявил на слушаниях, организованных республиканцами Палаты представителей ранее в этом месяце.
В интервью CBS News в четверг доктор Энтони Фаучи, который помогал руководить реакцией США на пандемию, сказал, что, возможно, мы никогда не получим окончательного ответа на вопрос о происхождении COVID.
«На самом деле нет никаких окончательных доказательств», — сказал он. «Возможно, мы никогда не узнаем точно и окончательно».
Проголосуйте, чтобы увидеть результаты