В каталоге "unknome" представлено около 2 млн. белков. Многие из них являются загадочными.

Новая база данных может быть использована для поиска способов лечения заболеваний или открытия лекарств

База данных "unknome" ранжирует человеческие белки по тому, насколько мало мы о них знаем. Многие белки и гены, которые их производят, изучены недостаточно хорошо, и нам еще предстоит многое узнать из генетической инструкции человека.

Когда речь заходит об огромных, малоизученных рубежах, на ум приходят космос и земные океаны. Но даже в человеческом организме еще многое предстоит открыть. Познакомьтесь с новой базой данных "unknome", которая подчеркивает, как много мы еще не знаем о генах и белках человека.

В этой общедоступной базе данных группы белков ранжированы по степени малоизвестности. Эта информация может помочь ученым определить белки для дальнейшего изучения, в том числе для лечения заболеваний и поиска лекарств, сообщают исследователи 8 августа в журнале PLOS Biology.

Клеточный биолог Шон Манро (Sean Munro) и его коллеги составили "unknome" - портмоне из слов "unknown" и "genome" - для выявления малоизученных, но потенциально важных белков и соответствующих им белок-кодирующих генов: ДНК, которая копирует рецепт белка в РНК (SN: 2/9/22).

Белки обычно объединяются в семейства, имеющие общего эволюционного предка. База данных unknome содержит все семейства белков, в которых есть хотя бы один белок, кодируемый генетической инструкцией, или геномом, человека, а также геномами 11 других широко изученных организмов. В базу включено более 13 000 групп и около 2 млн. белков.

В рамках программы unknome каждой группе белков присваивается балл "известности" в зависимости от того, насколько много известно о соответствующих генах. Около 3 тыс. групп, включая 805, содержащих хотя бы один человеческий белок, имеют нулевой балл известности, что свидетельствует о том, что в геноме человека еще многое предстоит узнать (SN: 3/31/22).

Мунро и его коллеги использовали эту базу данных для изучения 260 генов, общих для плодовых мушек и человека и имеющих низкий балл известности. Проанализировав активность каждого из генов, кодирующих белки, у мух, исследователи обнаружили, что около 60 из них необходимы для жизни. Другие важны для размножения, роста, движения и устойчивости к стрессу.

"Даже в таких хорошо изученных организмах, как мухи, можно найти что-то новое", - говорит Мунро из Лаборатории молекулярной биологии Совета по медицинским исследованиям в Кембридже (Англия).

Оказывают ли некоторые или все эти гены аналогичное воздействие на человека, пока неизвестно. Но база данных может помочь исследователям выявить важные человеческие белки путем быстрого скрининга аналогичных белков у более легко изучаемых организмов, таких как плодовые мушки, говорит специалист по данным Тудор Опреа из компании Expert Systems Inc. (Сан-Диего), занимающейся разработкой лекарств, который не принимал участия в исследовании.

По словам Мунро, следующим шагом его группы будет сотрудничество с аналогичными организациями, такими как Understudied Proteins Initiative, для широкомасштабного изучения этих загадочных белков.