Варианты коронавируса: вот что мы знаем

Омикрон, новейший вариант коронавируса, также быстрее всего был назван Всемирной организацией здравоохранения и Центрами по контролю и профилактике заболеваний США «вариантом, вызывающим озабоченность» из-за его, казалось бы, быстрого распространения в Южной Африке и многих вызывающих его беспокойств. Мутации.

Его появление уже привело к ограничениям на поездки, правительственным встречам на высоком уровне и обещаниям производителей вакцин начать работу над штамм-специфическими вакцинами на всякий случай.

Но ей предстоит пройти долгий путь, чтобы заменить Delta, вариант, который доминирует во всем мире. И длинный список вариантов, которые сначала пугали мир, прежде чем исчезнуть с карты, может быть напоминанием о том, что вирусы непредсказуемы.

Взгляните на названные варианты коронавируса.

Варианты, вызывающие беспокойство

ВОЗ обозначает варианты коронавируса либо как вызывающие озабоченность варианты, то есть они выглядят достаточно опасными, чтобы выдерживать тщательное изучение и постоянные обновления, либо как варианты, представляющие интерес, или как варианты, находящиеся под наблюдением. Только пять в настоящее время соответствуют определению вызывающих озабоченность вариантов: Alpha, Beta, Gamma, Delta и Omicron.

Омикрон

По данным ВОЗ, первый образец линии Omicron или B.1.1.529 был взят 9 ноября. Это было замечено из-за всплеска случаев заболевания в Южной Африке.

«Этот новый вариант, B.1.1.529, кажется, распространяется очень быстро!» Тулио де Оливейра, директор Центра Южной Африки эпидемического реагирования и инновации, и исследователь генетики в Стелленбошском университете, сказала на Twitter.

Кроме того, генетическое секвенирование показало, что он несет большое количество вызывающих беспокойство мутаций в шиповидном белке - шишковидной структуре на поверхности вируса, которую он использует для борьбы с инфицированными клетками.

Дорожные двери захлопываются, поскольку новый вариант Covid вызывает тревогу, бросая на мель сотни пассажиров

Некоторые из этих мутаций уже были распознаны из других вариантов и, как известно, делали их более опасными, в том числе мутация под названием E484A - слегка измененная версия мутации под названием E484K, которая может сделать вирус менее узнаваемым для некоторых антител - белков иммунной системы, которые являются передовой защитой от инфекции и составляют основу лечения моноклональными антителами.

Он также несет мутацию под названием N501Y, которая дала альфа и гамма их повышенную трансмиссивность. Буквально на прошлой неделе Скотт Уивер из Медицинского отделения Техасского университета и его коллеги сообщили в журнале Nature, что эта конкретная мутация улучшила репликацию вируса в верхних дыхательных путях - например, в носу и горле - и, вероятно, делает его более вероятным. Распространяться при дыхании, чихании и кашле.

Как и Delta, Omicron также несет мутацию под названием D614G, которая, по-видимому, помогает вирусу лучше прикрепляться к инфицированным им клеткам.

«Ранние данные свидетельствуют о том, что полностью вакцинированные люди, инфицированные вариантом Omicron, могут передавать вирус другим. Ожидается, что все одобренные или разрешенные FDA вакцины будут эффективны против тяжелых заболеваний, госпитализаций и смертей», - говорится на сайте CDC. .

«Количество мутаций само по себе не означает, что новый вариант вызовет какие-либо проблемы; хотя он может с большей вероятностью отличаться от иммунной системы», - сказал доктор Питер Инглиш, бывший председатель Медицинской службы общественного здравоохранения Британской медицинской ассоциации. Комитет, говорится в сообщении.

Ученых беспокоит количество мутаций, влияющих на спайковый белок. Это потому, что большинство ведущих вакцин нацелены на спайковый белок. Вакцины, производимые Pfizer / BioNTech, Moderna, Johnson & Johnson, AstraZeneca и другими компаниями, используют только небольшие части или генетические последовательности вируса, а не весь вирус, и все они используют кусочки белка-шипа, чтобы вызвать иммунитет. Таким образом, изменение белка-шипа, которое сделало его менее узнаваемым для белков иммунной системы и клеток, стимулированных вакциной, будет проблемой.

Новый вариант Omicron - это проверка кишечника на пандемию

Пока нет никаких доказательств того, что это произошло, но невозможно узнать, глядя только на мутации. Исследователям придется подождать и посмотреть, вызывает ли Омикрон больше прорывных инфекций, чем другие варианты.

Другой страх заключается в том, что мутации могут помочь сделать вирус менее восприимчивым к лечению моноклональными антителами. Однако ВОЗ заявляет, что маловероятно, что эти мутации повлияют на другие методы лечения Covid-19, включая разрабатываемые противовирусные препараты и стероид дексаметазон.

Омикрон был обнаружен во многих странах, включая Южную Африку и Ботсвану, а также среди путешественников в США, Бельгию, Нидерланды, Австралию, Канаду, Великобританию, Италию, Израиль и Австрию, согласно базе данных GISAID и местным властям. Первый случай в США был полностью привит путешественником из Южной Африки, который прибыл в Калифорнии 22 ноября и который дал положительный результат после того, как испытывают легкие симптомы.

Требуется дополнительный уровень тестирования помимо стандартных тестов, чтобы обнаружить инфекцию, чтобы определить, какой вариант коронавируса заразил кого-то. Необходимо провести генетическое секвенирование, и это займет больше времени, чем быстрый тест на антиген или ПЦР.

Что мы знаем о варианте Omicron

Еще слишком рано говорить, вызывает ли Омикрон более тяжелое заболевание, хотя один врач, лечивший некоторых пациентов в Южной Африке, сказал Reuters, что у ее пациентов были только легкие симптомы. «Самая распространенная клиническая жалоба - это сильная усталость в течение одного или двух дней, с последующей головной болью, ломотой в теле и болью», - сказала доктор Анжелика Кутзее, частнопрактикующий врач и председатель Южноафриканской медицинской ассоциации.

Но врачи согласны с тем, что вакцинация, вероятно, обеспечит большую защиту от Омикрона, и побуждают людей пройти вакцинацию, если они еще не сделали этого. Примечание: вакцинировано чуть менее 24% всего населения Южной Африки. Президент страны Сирил Рамафоса заявил в воскресенье, что всего 35% взрослых южноафриканцев полностью вакцинированы. А в Южной Африке много людей, инфицированных ВИЧ, который подавляет иммунную систему, которые в настоящее время не могут получить лечение и могут быть более восприимчивыми к инфекции.

Эти факторы могут повлиять на рост этого варианта в Южной Африке, в отличие от стран, где больше людей вакцинировано и меньше людей имеют иммунодефицитные состояния.

Физические барьеры также будут работать против любого мутантного вируса. К ним относятся маски, мытье рук, физическое дистанцирование и хорошая вентиляция. «Очень неясно, но мы знаем, что работает по сравнению с CoV-19: - улучшение вентиляции в помещении - качественные маски / респираторы - избегание скопления людей в помещении - дистанцирование - тестирование, изоляция, карантин - вакцина + бустер для Delta», - д-р Джеффри Дучин, здоровье Офицер Сиэтла и округа Кинг, написал в Твиттере в воскресенье.

Директор NIH: новый вариант Covid-19 «должен удвоить» усилия по вакцинации и смягчению последствий

Хотя эксперты говорят, что внимательно следят за этим, некоторые из них заявили, что пока не особенно беспокоятся об Omicron.

"Я не думаю, что мы должны паниковать", - сказал CNN Роберт Гарри, профессор микробиологии и иммунологии Медицинской школы Тулейнского университета.

"Небо не падает", - сказал CNN доктор Питер Хотез, декан Школы тропической медицины в Бейлоре. «Мы не видели никаких доказательств того, что Омикрон вызывает более серьезное заболевание, чем любые другие варианты».

Дельта

Дельта-вариант коронавируса является доминирующей линией в США и большей части мира. По данным Центров США по контролю и профилактике заболеваний, на вариант Delta приходится 99,9% случаев в США.

Также известный как B.1.617.2, он явно более передается, чем другие варианты, но до сих пор неясно, вызывает ли он более тяжелое заболевание.

Он быстро заменил вариант B.1.1.7 или Alpha в большинстве стран.

Дельта также несет группу мутаций в белке шипа. Он также может ускользнуть от иммунной системы, что может означать, что люди, которые были однажды инфицированы более старым вариантом, могут с большей вероятностью заразиться им снова. Он также избегает воздействия лечения моноклональными антителами, называемого бамланивимабом, производимого Eli Lilly and Company, но уязвим для защиты, обеспечиваемой другими препаратами для лечения моноклональными антителами.

**************************************************************************************

Альфа

Вариант коронавируса B.1.1.7 или альфа, впервые выявленный как вариант, вызывающий озабоченность в декабре прошлого года, вызывал беспокойство у чиновников здравоохранения прошлой весной. Она быстро прокатилась по Англии, а затем распространилась по миру, быстро став доминирующей линией в Соединенных Штатах. В настоящее время CDC понижает его в должности до «контролируемого варианта» из-за его низкого воздействия в США.

Было показано, что он по крайней мере на 50% более передается, чем более старые линии. Он несет 23 мутации, в том числе мутацию N501Y, которая увеличивает передачу.

Он полностью восприимчив к лечению моноклональными антителами и вакцинами.

***************************************************************************************

Бета

Впервые замеченный в Южной Африке, вариант B.1.351 или бета имеет как мутацию E484K, которая связана с иммунным бегством, так и мутацию N501Y, которая, как предполагается, способствует повышению заразности многих других вариантов. Было показано, что он на 50% более трансмиссивен, чем более старые штаммы, и избегает лечения двойными моноклональными антителами Лилли, но не другими.

Как анализы крови, так и использование в реальной жизни предполагают, что он может заразить людей, выздоровевших от коронавируса, а также людей, которые были вакцинированы против Covid-19.

Производители вакцин, пытающиеся опередить новые варианты, разрабатывая бустерные вакцины, сосредоточили внимание на B.1.351, поскольку это вариант, которого ученые больше всего опасаются, может ускользнуть от защиты вакцины. Но частичный побег не означает полный побег, и ожидается, что вакцины в некоторой степени защитят людей.

Его обогнала компания Delta в Южной Африке, и она никогда не закреплялась в США, несмотря на беспокойство, которое она вызывала, и теперь обозначена как вариант, отслеживаемый CDC.

**************************************************************************************

Гамма

Вариант P.1 или Gamma, охвативший Бразилию, также не получил широкого распространения где-либо еще и теперь также является контролируемым вариантом CDC.

Гамма несет мутации E484K и N501Y, а также более 30 других. Было продемонстрировано, что он избегает эффекта лечения моноклональными антителами Лилли, но не препаратом Регенерон. Анализы крови показывают, что он может частично избежать как естественных, так и вызванных вакцинами иммунных ответов.

Интересные варианты ВОЗ

Лямбда: Лямбда или C.37 был признан представляющим интерес вариантом ВОЗ в июне. CDC не упоминает об этом.

Mu: Mu или B.1.621 вызвал шквал страха, когда в августе был объявлен вариантом интереса ВОЗ, но вскоре рассеялся. Теперь он обозначен как вариант, отслеживаемый CDC.

Варианты, отслеживаемые CDC

Все следующие варианты перечислены CDC как отслеживаемые варианты.

Эпсилон: Варианты B.1.427 и B.1.429 обычно объединяются вместе и известны как Эпсилон. Впервые замеченный в Калифорнии, он имеет ту же мутацию L452R, которую несет Delta, но не имеет некоторых других его мутаций, и не имеет такого распространения, как Delta.

Южноафриканские исследователи настороженно следят за еще одним новым вариантом коронавируса.

Йота: Впервые увиденный в Нью-Йорке в ноябре прошлого года, вариант B.1.526 или йота сначала распространился, составляя целых 9% образцов в апреле прошлого года, но теперь он практически исчез. У него есть так называемая мутация 484, которая должна помочь вирусу легче прикрепляться к инфицированным им клеткам и сделать вирус менее узнаваемым для иммунной системы.

Зета: Циркулирующий в Бразилии с прошлого года, этот вариант, также известный как P.2, также несет мутацию E484K и не был широко обнаружен во всем мире. По данным CDC, в США он почти исчез.

Нет вариантов, обозначенных Nu или Xi. ВОЗ решила, что «Ну» слишком похоже на английское слово «новый», а Си - это обычная фамилия.

Эта история была исправлена, чтобы показать, что Omicron несет мутацию под названием E484A, которая похожа на E484K, но не совсем такая же.

Eta: Впервые обнаруженная в Великобритании и Нигерии, Eta, также известная как B.1.525, несет мутацию E484K. Он также практически исчез.