Три препарата могут лечить коронавирус, новое обширное исследование

Совместная исследовательская группа из KAIST и Institut Pasteur Korea определила перепрофилированные препараты для лечения COVID-19 с помощью виртуального

скрининга и клеточных анализов. Исследовательская группа предложила стратегию виртуального скрининга со значительным сокращением ложных срабатываний за счет включения предварительной фильтрации на основе сходства форм и пост-стыковочной фильтрации на основе сходства взаимодействий. Эта стратегия поможет быстрее разработать терапевтические препараты от COVID-19 и других противовирусных заболеваний. Это исследование было опубликовано в Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (PNAS ), пишет medicalxpress.com.

Исследователи проверили 6218 лекарств из набора одобренных FDA лекарств или тех, которые проходят клинические испытания, и выявили 38 потенциальных перепрофилированных лекарств от COVID-19 с этой стратегией. Среди них семь соединений ингибировали репликацию SARS-CoV-2 в клетках Vero. Три из этих препаратов, эмодин, омипалисиб и типифарниб, показали активность против SARS-CoV-2 в клетках легких человека, Calu-3.

Перепрофилирование лекарств - это практическая стратегия разработки противовирусных лекарств за короткий период времени, особенно во время глобальной пандемии. Во многих случаях перепрофилирование лекарств начинается с виртуального скрининга одобренных лекарств. Однако фактическая эффективность виртуального скрининга низка, и большинство предсказанных кандидатов на лекарства являются ложноположительными.

Исследовательская группа разработала эффективные алгоритмы фильтрации до и после моделирования стыковки, чтобы улучшить процент попаданий. В процессе фильтрации перед стыковкой были выбраны соединения с формами, аналогичными известным активным соединениям для каждого целевого белка, и использованы для моделирования стыковки. В процессе фильтрации после стыковки химические вещества, идентифицированные посредством моделирования стыковки, оценивались с учетом энергии стыковки и сходства взаимодействий белок-лиганд с известными активными соединениями.

Результаты экспериментов показали, что стратегия виртуального скрининга достигла высокого показателя эффективности 18,4%, что привело к идентификации семи потенциальных лекарств из 38 первоначально выбранных лекарств.

источник: https://kurer-sreda.ru/

и