Короновирус против самого крутого ПК в мире.

Covid-19 досихпор бушует во всем мире. Победить его может помочь самый мощный ПК в мире от IBM-IBM Sammit.

Sammit-ПК ОК-Риджской нацлаборатории из штата Теннеси, США.Этото компьютер занимает площадь, как два теннисных корта. Он может выполнять 200 квадриллионов операций в секунду, в миллион раз быстрее за обычный ноутбук.

За последний месяц этот суперкомпьютер проанализировал библиотеку примерно из 8000 известных в настоящее время лекарственных соединений, чтобы найти потенциально эффективные в борьбе с Covid-19. К ним относятся химические, натуральные и растительные продукты, которые никогда не тестировались на людях и находятся в списке одобренных лекарств. Саммиту удалось сократить огромный состав до 77 мест всего за два дня. Обычным компьютерам потребовались бы месяцы, чтобы выполнить эту работу.

Молекулярный биофизик из Университета Теннесси Джереми Смит так объяснил идею проекта: если какое-либо из выбранных соединений окажется подходящим, это значительно ускорит процесс разработки препарата, сразу переведя его на стадию утверждения, а затем введение его в употребление.

На сайте Chem Rxiv профессор вместе со своим коллегой вылаживает и все время обновляет данные с этого ПК.

Если соединение будет хорошо работать на животных, первый этап испытаний на людях можно будет пропустить: тогда ученые приступят к проверке эффективности препарата сразу на инфицированных людях.

В ходе своего исследования Смит работал с геномом вируса SARS-CoV-2, который был опубликован в сети китайскими исследователями в январе 2020 года. Согласно этим данным, он имеет много общего с коронавирусом, вызывающим SARS (тяжелый острый респираторный синдром, по-английски — SARS). Заражение организма происходит по аналогичному принципу. Основываясь на этой информации, исследователи запрограммировали суперкомпьютер на поиск подходящего лекарственного соединения.

Очень важно понять, почему коронавирус так называется. Он обязан своим названием короноподобным белкам, обнаруженным на всей его поверхности. Благодаря им вирус прикрепляется к клеткам человеческого организма и заражает организм. С помощью Summit ученые пытаются найти вещества, способные связывать белковые шипы, чтобы вирус не мог проникнуть в клетки.

Основная трудность заключается в том, что эти спайки постоянно находятся в движении, а значит, чтобы найти препараты, способные их нейтрализовать, нужно сначала смоделировать каждое из мелких движений. Вице-президент IBM Дэвид Турек сказал газете OneZero, что эта математическая задача чрезвычайно сложна. В конце концов, экзафлопсные вычисления требуют, чтобы в секунду выполнялось не менее триллиона вычислительных процессов...