Можно ли восстановить отцовство через суд в России и обойти требование консула о генетической экспертизе для репатриации?

Добрый день. Лучше сделать так, как Вам указали. Законодательство РФ на представителей консульства Израиля не распространяется (если законом Израиля установлены иные требования)

если правильно понимаю, Вы в данный момент достигли соершеннолетия.

Согласно ст.52 Семейного Кодекса РФ

1. Запись родителей в книге записей рождений, произведенная в соответствии с пунктами 1 и 2 статьи 51 настоящего Кодекса, может быть оспорена только в судебном порядке по требованию лица, записанного в качестве отца или матери ребенка, либо лица, фактически являющегося отцом или матерью ребенка, а также самого ребенка по достижении им совершеннолетия, опекуна (попечителя) ребенка, опекуна родителя, признанного судом недееспособным.

2. Требование лица, записанного отцом ребенка на основании пункта 2 статьи 51 настоящего Кодекса, об оспаривании отцовства не может быть удовлетворено, если в момент записи этому лицу было известно, что оно фактически не является отцом ребенка.

Таким образом, Вы вправе обратиться в суд в России с исковым заявлением об оспаривании отцовства, в рамках судебного разбирательства будет назначена генетическая экспертиза.

На основании решения суда будет установлено, что именно тот гражданин является Вашим отцом, а не тот что указан в свидетельстве о рождении. При наличии решения суда консул уже ничего не сможет требовать дополнительно.