Как избавиться от нежелательных арендаторов и исключить их из базы налоговой?

Можете написать соответствующее письмо в налоговую. Кроме того, если эти 15 ООО не платят арендную плату, то сначала пишите им претензию, а потом обращайтесь в суд для взыскания долга и расторжения договора аренды.

Федеральный закон от 08.08.2001 N 129-ФЗ (ред. от 28.12.2016) "О государственной регистрации юридических лиц и индивидуальных предпринимателей" (с изм. и доп., вступ. В силу с 01.01.2017)

Статья 23. Отказ в государственной регистрации

1. Отказ в государственной регистрации допускается в случае:

р) при наличии у регистрирующего органа подтвержденной информации о недостоверности содержащихся в представленных в регистрирующий орган документах сведений, предусмотренных подпунктом "в" пункта 1 статьи 5 настоящего Федерального закона;

Обратитесь с заявлением в налоговый орган.

Добрый день, Марина Евгеньевна! Вам необходимо в судебном порядке расторгать договора аренды и взыскивать сумму задолженности по каждому арендатору... И с решением суда обратиться в МРИ ФНС для решения данного вопроса по исключению из базы...

Вы можете сдавать в аренду помещения не предоставляя юридического адреса для регистрации ООО. Проблем будет у вас меньше. В территориальную налоговую пишите заявление о том, что компании на данном адресе не находятся, указываете наименовании компании и адрес, где они зарегистрированы, предоставляете свидетельство (копию) о собственности. Налоговая в сведении ЕГРЮЛ внесет запись о том, что у данной компании недостоверные сведения о место нахождении. Но на адресе они так и будут висеть, пока их не исключат из ЕГРЮЛ.