Как продлить пребывание в РФ?

Здравствуйте! Автор этого письма является гражданином РФ и жителем г.Москвы (постоянно зарегистрирован). Зимой этого года я женился на гражданке Кыргызстана и сразу появилась проблема ее пребывания в России. Мы уже один раз просрочили регистрацию на один(!) день по вине домоуправления и ей пришлось выезжать за пределы страны, будучи беременной. Одновременно мы подали документы на РВП (разрешение на временное пребывание в России), однако моей жене был дан отказ за допущенную ошибку при заполнении анкеты(в УФМС это квалифицировали как ложную информацию) с правом переподачи заявления через год или обжалования отказа в суде. 06 июля 2012 года моя жена родила дочку и одновременно у нее 15-го июля заканчивается время временной регистрации в РФ(в Москве). В отделении УФМС по месту жительства нам отказали в продлении пребывания в РФ, так как у моей жены нет на то оснований. Мы понимаем, что иностранный гражданин обязан выехать из РФ после 90 суток пребывания и мы бы готовы сделать это, но моей жене тяжело передвигаться после родов, надо заниматься регистрацией ребенка во всех гражданских инстанциях, к тому же у ребенка обнаружили шум в сердце...Что надо сделать на законных основаниях, чтобы моей жене продлили пребывание в России?