Год назад развелась с мужем дети были прописанны со мной но он их выписал и прописал у себя без моего ведома что теперь делать

Значит, и дом ваш общий, несмотря на то, что оформлен только на бывшего супруга. Согласно ст. 34 СК РФ:

1. Имущество, нажитое супругами во время брака, является их совместной собственностью.

2. К имуществу, нажитому супругами во время брака (общему имуществу супругов), относятся... любое другое нажитое супругами в период брака имущество независимо от того, на имя кого из супругов оно приобретено либо на имя кого или кем из супругов внесены денежные средства...

Таким образом, оба дома являются вашей совместной собственностью с бывшим супругом, и вы вправе зарегистрироваться в доме, где собственником пока числится только бывший супруг.

Теперь к основному вопросу: что делать? Можете обратиться в суд с исками о разделе совместно нажитого им-ва, об определении места жительства детьми с вами и взыскании алиментов на их содержание с бывшего супруга, и т.д.

То, что у вас нет сейчас пригодного для проживания детей жилья, - не страшно. Согласно ст. 86 СК РФ:

1. При отсутствии... пригодного для постоянного проживания жилого помещения... каждый из родителей может быть привлечен судом к участию в несении дополнительных расходов, вызванных этими обстоятельствами.

Т.е., вы вправе взыскать с бывшего супруга и дополнительные алименты на наем др. жилья для проживания с детьми, пока будет решаться вопрос с разделом совместно нажитого им-ва.