Я принципиально не плачу налоги по этой причине, но как мне защититься юридически?

Уважаемый Сергей.

Налоговая здесь ни причем. Она определяет сумму налога исходя из сведений, предоставленных ей ГИБДД. Вот что говорится об этом в главе 28 Налогового кодекса РФ (часть 2):

Статья 362. Порядок исчисления налога

4. Органы, осуществляющие государственную регистрацию транспортных средств, обязаны сообщать в налоговые органы по месту своего нахождения о транспортных средствах, зарегистрированных или снятых с регистрации в этих органах, а также о лицах, на которых зарегистрированы транспортные средства, в течение 10 дней после их регистрации или снятия с регистрации.

5. Органы, осуществляющие государственную регистрацию транспортных средств, обязаны сообщать в налоговые органы по месту своего нахождения сведения о транспортных средствах, а также о лицах, на которых зарегистрированы транспортные средства, по состоянию на 31 декабря истекшего календарного года до 1 февраля текущего календарного года, а также обо всех связанных с ними изменениях, произошедших за предыдущий календарный год.

Для того, чтобы избежать начисления штрафных санкций за несвоевременную уплату налога или существенного его уменьшения в случае обращения налоговиков в суд, вам следует направить в налоговый орган заказное письмо с уведомлением, в котором изложить ситуацию, приложить копии документов и потребовать перерасчета налога. Второе требование о внесении соответствующих изменений в регистрационные данные направьте в ГИБДД. И обязательно потребуйте уведомить вас о принятых мерах. "Неподтвержденный" факс не уменьшит период начиления пени.

С уважением,