Освобождение от уплаты НДС при приватизации по 159-ФЗ от 22.07.2008 после 01.04.2011

Добрый день! Юридическое лицо ( на УСН) покупает муниципальное имущество с рассрочкой платежа по 159-ФЗ от 22.07.2008. и становится налоговым агентом. Договор заключен в 2012 году и по п.п. 12 п. 2 ст. 146 НК РФ( вступишим в силу с 01.04.2011.) не является объектом налогообложения НДС.

С этим вопросов нет – НДС, по таким сделкам, не платится однозначно с 01.04.20011 года

Но в договоре купли-продажи сказано: Цена договора включает в себя стоимость имущества, равную его рыночной стоимости, в размере 3 330 000 рублей, в том числе НДС 503 390 рублей. Покупатель обязан оплатить НДС отдельным платежным документом.

Эту формулировку продавец имущества не смог написать иначе т.к. весь текст договора прописан в решении суда ( мы судились с ними по цене ). Естественно продавец просил разъяснить решение суда по поводу НДС т.к. судится начинали в 2009 году и тогда НДС покупатель платил и даже его (НДС) начисляли сверху выкупной цены.Но суд ответил, что не будет ничего разъяснять т.к. всем все должно быть понятным. И теперь вопрос: Платить всю сумму продавцу или удержать НДС, дословно следуя тексту договора и, согласно п.п. 12 п. 2 ст. 146 статьи НК, оставить его у себя?

Читал на форуме - « если в договоре купли продажи предъявляется НДС отдельно от цены, то его надо удержать и оставит у себя».

А как Вы считаете?

С уважением Сергей