могу ли я использовать материнский капитал для покупки дома у моей матери, но я и вся моя семья прописаны в этом доме.

Федеральный закон от 29.12.2006 N 256-ФЗ (ред. от 02.07.2013) "О дополнительных мерах государственной поддержки семей, имеющих детей"

..3. Лица, получившие сертификат, могут распоряжаться средствами материнского (семейного) капитала в полном объеме либо по частям по следующим направлениям:

1) улучшение жилищных условий...

В данном случае государственный орган скорее всего не признает наличия улучшения жилищных условий, т.к. у Вас фактически данные жилищные условия уже имеются.

Суд также может встать на сторону пенсионного органа в возможном споре. В похожем случае, в Апелляционном определении Томского областного суда от 23.08.2013 по делу N 33-2462/2013 указано:

Судебная коллегия полагает, что приобретение по 1/20 доли в праве общей собственности на квартиру на имя истицы и ее несовершеннолетних детей с учетом целей, установленных Федеральным "законом" от 29.12.2006 года N 256-ФЗ "О дополнительных мерах государственной поддержки семей, имеющих детей", не может быть расценено как улучшение жилищных условий. К.У. и ее несовершеннолетние дети по-прежнему проживают в вышеуказанном жилом помещении, продавец 1/5 доли в праве общей долевой собственности К.Ф. сохранил право проживания в квартире. При этом размер приобретенных долей несовершеннолетних детей с учетом доли остальных сособственников жилого помещения является сравнительно малым и фактически не может считаться улучшением жилищных условий посредством использования средств материнского капитала с учетом также того обстоятельства, что истица до совершения сделки имела на праве собственности часть вышеуказанного жилого помещения.

При таких обстоятельствах решение пенсионного орган принято на законных основаниях, оснований для признания его незаконным у суда не имелось.

Можете. Факт регистрации в том же доме не является препятствием для покупки с использованием материнского капитала.

Приведен не удачный пример. Как указано в вопросе, предполагается покупка дома, а не какой-то доли, тем более очень маленькой, как указано в решении суда.

Федеральный закон от 29.12.2006 N 256-ФЗ (ред. от 02.07.2013) "О дополнительных мерах государственной поддержки семей, имеющих детей"

..3. Лица, получившие сертификат, могут распоряжаться средствами материнского (семейного) капитала в полном объеме либо по частям по следующим направлениям:

1) улучшение жилищных условий...

Законом никаких ограничений по покупке за средства мат капитала жилього дома у близких родственников неьпредусмотрено.

Можете приобрести дом с земельным участком в долевую собственность родителей и всех детей. Если ребенку исполнилось три года, то мат.капитал перечисляется напрямую продавцу. Если трех лет не исполнилось, то мат.капиталом можно только погасить кредит (займ), полученный для приобретения дома и зем.участка. Факт регистрации всей семьи в доме не имеет никакого значения для совершения сделки с использованием средств мат.капитала.