Как правильно поступить при отсутствии заявления на отпуск по уходу в компании?

Помогите, пожалуйста, разобраться в сложившейся ситуации. Фактически я работаю в иностранной компании на полставки, т.к.штат у них маленький, то официально я трудоустроена в аутстаффинговом кадровом агенстве.

В 2013 году в апреле ушла в декретный отпуск. О том, что после того как закончится декретный отпуск необходимо написать заявление на отпуск по уходу кадровая служба меня не проинформировала (понимаю, что сама виновата, но я действительно не знала, когда и как его нужно писать). В итоге год и три месяца мне начислялась з/п,при том, что никакой отчётности с моей стороны не было. Я думала, что в компании просто декретные такие (в силу того, что на половинне ставки з/п маленькая). По прошествии этого времени мне позвонила сотрудница кадровой службы и сообщила, что они проводили ревизию документов и обнаружили, что моего заявления на отпуск по уходу нет, и поэтому системой считается явка на работу и соответственно начисляется з/п (раньше я ежемесячно отчитывалась о работе табелем рабочего времени за подписью моего непосредственного руководителя). Мне сказали написать заявление на отпуск по уходу задним числом (прошёл год и 3 месяца) с тем, чтобы они могли сделать перерасчет и удержать переплату.

Подскажите, пожалуйста, как мне следует поступить в данной ситуации?

Заранее спасибо!