Вопрос возвращения предоплаты за индивидуальный заказ мебели - возможно ли отказать покупателю или удержать часть суммы?

Если индивидуально -определённая вещь, то можете передать товар и отказать возврате. Но будет ли расцветка признана индивидуально опредённой, не уверен.

иначе придётся возвращать полностью

Смотря как договор составлен. Если речь об оказании услуг, то можете требовать от него возмещение Ваших расходов.

Гражданский кодекс РФ

Статья 782. Односторонний отказ от исполнения договора возмездного оказания услуг

1. Заказчик вправе отказаться от исполнения договора возмездного оказания услуг при условии оплаты исполнителю фактически понесенных им расходов...

Закон РФ от 07.02.1992 N 2300-1 "О защите прав потребителей"

Статья 32. Право потребителя на отказ от исполнения договора о выполнении работ (оказании услуг)

Потребитель вправе отказаться от исполнения договора о выполнении работ (оказании услуг) в любое время при условии оплаты исполнителю фактически понесенных им расходов, связанных с исполнением обязательств по данному договору.

Вот на это и ссылаться и документально доказать свои расходы.

Закон о защите прав потребителей. № 2300-1. Статья 32

Статья 32. Право потребителя на отказ от исполнения договора о выполнении работ (оказании услуг)

(в ред. Федерального закона от 21.12.2004 N 171-ФЗ)

Потребитель вправе отказаться от исполнения договора о выполнении работ (оказании услуг) в любое время при условии оплаты исполнителю фактически понесенных им расходов, связанных с исполнением обязательств по данному договору.