Что мне делать, если прав окажусь я, а работодатель откажется выплачивать отпускные в законном порядке?

Отпускные должны рассчитываться в полном соответствии с трудовым кодексом и других толкований быть не должно. Если весь доход отражен в справке2-НДФЛ, значит весь Ваш заработок легален, и ВАм нечего бояться что Вы потеряли свой трудовой договор. В любом случае Вам по письменному заявлению на имя директора должны выдать копию.

Выписку из ст. 139 ТК РФ прилагаю, обратите внимание на части 2 и 4.

Статья 139. Исчисление средней заработной платы

1. Для всех случаев определения размера средней заработной платы (среднего заработка), предусмотренных настоящим Кодексом, устанавливается единый порядок ее исчисления.

(в ред. Федерального закона от 30.06.2006 N 90-ФЗ)

2. Для расчета средней заработной платы учитываются все предусмотренные системой оплаты труда виды выплат, применяемые у соответствующего работодателя независимо от источников этих выплат.

(в ред. Федерального закона от 30.06.2006 N 90-ФЗ)

3. При любом режиме работы расчет средней заработной платы работника производится исходя из фактически начисленной ему заработной платы и фактически отработанного им времени за 12 календарных месяцев, предшествующих периоду, в течение которого за работником сохраняется средняя заработная плата. При этом календарным месяцем считается период с 1-го по 30-е (31-е) число соответствующего месяца включительно (в феврале - по 28-е (29-е) число включительно).

(в ред. Федерального закона от 30.06.2006 N 90-ФЗ)

4. Средний дневной заработок для оплаты отпусков и выплаты компенсации за неиспользованные отпуска исчисляется за последние 12 календарных месяцев путем деления суммы начисленной заработной платы на 12 и на 29,4 (среднемесячное число календарных дней).

(в ред. Федерального закона от 30.06.2006 N 90-ФЗ)

И еще помните, что все редакции к трудовому договор должны изменяться дополнительными соглашениями, которые подписаны обеими сторонами.