Могу ли я по истечении какого-то срока его выписать?

К сожалению, муж не может утратить права пользования квартирой, если только сам не снимется с регистрации. Можно признать его безвестно отсутствующим, если в течение года нет сведенией о его местонахождении (видимо это не так), и снять с регистрации, но если он найдется то восстановится в своих правах.

Также можете разделить лицевой счет через суд если комнаты изолированные, платить только за себя.

Вы можете обратиться в суд с иском о признании бывшего супруга утратившим право пользования жилой площадью в соответствии со ст. 60,61 Жилищного кодекса РСФСР. Между тем судебная практика показывает, что подобные исковые требования удовлетворяются судом нечасто, к сожалению. Это связано с решениями, принятыми Конституционным судом РФ (см., в частности Постановление Конституционного Суда РФ "По делу о проверке конституционности части первой и пункта 8 части второй статьи 60 Жилищного кодекса РСФСР в связи с запросом Муромского городского народного суда Владимирской области и жалобами граждан Е. Р. Такновой, Е. А. Оглоблина, А. Н. Ващука" от 23.06.95 N 8-П. Закон не устанавливает какого-либо срока, по истечении которого возможно признать лицо утратившим право пользования и на данном основании снять с регистрационного учета. С уважением,