Проблемы с постановкой автомобиля на учет из-за наложенного ареста и неуплаты штрафа - примут ли ГИБДД копию документа по электронной почте и как поступить с договором купли-продажи?

Примут ли во внимание такой документ ГИБДД?

Нет не примут, нужен оригинал документа, подтверждающего оплату, кроме того предъявлять его нужно по месту нахождения ОСП, а это как правило по месту регистрации продавца.

Как поставить авто на учет?

Необходимо , чтобы продавец обратился в ОСП с квитанцией об оплате и получил у пристава - исполнителя постановление об отмене запрета на рег. действия с ТС, которое нужно предъявить в рег. органы ГИБДД.

Продавец просит ему вернуть один договор

Вполне правомерно, количество договоров равно количеству сторон, в данном случае два - один у продавца, другой у покупателя.

Тут возможно несколько вариантов развития. Но прежде всего зайдите на сайт Управления ФССП по Алтайскому краю http://r22.fssprus.ru/, найдите там банк данных исполнительных производств, введите данные продавца если штраф не оплачен, свяжитесь с продавцом и пусть он , как посоветовал коллега, отнесет квитанцию в ОСП и чтобы тот направил постановление о снятии ареста в ГИБДД и один экземпляр выдал ему на руки.а с ним в ГИБДД. Если же штраф не оплачен, то самый эффективный вариант обратиться в суд, по месту нахождения автомобиля с исковым заявлением об освобождении имущества из под ареста.

Кстати у вас есть хороший козырь в разговоре с Продавцом , ему ведь нужен договор. Попросите его немедля унести квитанцию в ОСП и получить Постановление о снятии ареста а вы ему за это договор