как быть если командир роты порвал рапорт и отказывает перевести в другую часть на выше стоящую должность.

В п.1 ст. 15 Положения о порядке прохождения военной службы указаны основания для перевода.

Военнослужащий может быть переведен к новому месту военной службы из одной воинской части в другую (в том числе находящуюся в другой местности) в пределах Вооруженных Сил Российской Федерации (других войск, воинских формирований или органов, воинских подразделений федеральной противопожарной службы) в следующих случаях:

а) по служебной необходимости;

б) в порядке продвижения по службе;

в) по состоянию здоровья в соответствии с заключением военно-врачебной комиссии;

г) по семейным обстоятельствам по личной просьбе (для военнослужащих, проходящих военную службу по контракту);

д) по личной просьбе (для военнослужащих, проходящих военную службу по контракту);

е) в связи с организационно-штатными мероприятиями;

ж) в связи с плановой заменой (для военнослужащих, проходящих военную службу по контракту);

з) в связи с зачислением в военно-учебное заведение, адъюнктуру, военную докторантуру;

и) в связи с отчислением из военно-учебного заведения, адъюнктуры, военной докторантуры;

к) если с учетом характера совершенного преступления военнослужащий, которому назначено наказание в виде ограничения по военной службе, не может быть оставлен в должности, связанной с руководством подчиненными.

Исходя из данной нормы это право командира разрешать перевод.

Но порвать рапорт он не имеет право, а обязан рассмотреть в порядке приказа МО РФ 2014 г. №555.

В такой ситуации нужно подать новый рапорт и на втором экземпляре рапорта сделать отметку о том, что ваш рапорт приняли. Нужно дождаться ответа, а в случае необоснованного отказа обжаловать в суд.