13% налог за аренду, а из КУ надо ли вычитать стоимость воды и электричества?, а как платить налог за 6, 8, 9 месяцев?

Вы не написали про свой статус: Вы зарегистрированы в качестве индивидуального предпринимателя или нет. Если Вы сдаете имущество в аренду как ИП, то можете уменьшить свой доход на документально подтвержденные расходы, в том числе и на коммунальные расходы. Если Вы не зарегистрированы как ИП, то в расходы ничего не ставите.

Физ. лица платят НДФЛ 1 раз по итогам года не позднее 15 июля года, следующего за отчетным.

Вы должны заплатить налог с суммы, полученной от арендатора за налоговый период (в данном случае "нанимателя") по договору найма. Для того, чтобы не оплачивать налог с суммы, которую наниматель выплачивает для компенсации оплаты коммунальных платежей, при составлении договора прописывайте их отдельным пунктом.

Например, Вы сдаете квартиру за 30000 рублей, 8000 руб. из них уходит на оплату КУ. Пропишите в цене Договора найма 22000 руб., а в пункте договора обязанности нанимателя пропишите - наниматель обязуется ежемесячно оплачивать КУ, подачу горячей и холодной воды, электричества согласно приборам учета и т.д. Тогда и налог Вы будете оплачивать с суммы 22000 руб, указанной в договоре. В графике платежей тоже пропишите сумму 22000 руб. Вам останется только контролировать оплату КУ нанимателя или получать с него деньги по факту и самостоятельно оплачивать КУ, свет и т.д.

Надеюсь мой ответ был полезным для вас.

Удачи!