Как зарегистрировать дочь, родившуюся в России при смене гражданства и отсутствии отца в свидетельстве о рождении?

Зарегистрировать или принять её в российское гражданство? Если принять в российское гражданство, то подайте заявление в территориальный орган МВД РФ о приёме дочери в российское гражданство.

Указ Президента РФ от 14.11.2002 N 1325 (ред. от 06.10.2020) "Об утверждении Положения о порядке рассмотрения вопросов гражданства Российской Федерации" (с изм. и доп., вступ. В силу с 12.10.2020)

18. Вместе с заявлением родителей, одного из родителей или единственного родителя о приеме в гражданство Российской Федерации ребенка, проживающего на территории Российской Федерации, представляются:

свидетельство о рождении ребенка, а также паспорт ребенка (при его наличии);

документ, подтверждающий проживание ребенка на территории Российской Федерации (вид на жительство либо разрешение на временное проживание ребенка, вид на жительство либо разрешение на временное проживание одного из родителей или единственного родителя с указанием сведений о ребенке, выписка из домовой книги или копия поквартирной карточки, копия финансового лицевого счета, копия отрывной части бланка уведомления о прибытии иностранного гражданина или лица без гражданства в место пребывания);

согласие ребенка в возрасте от 14 до 18 лет на приобретение гражданства Российской Федерации, оформленное в соответствии с абзацем третьим пункта 5 настоящего Положения.

Зарегистрировать. Ведь чтобы подать на гражданство нужно ее где-то зарегистрировать. Вы как раз этот пункт и прислали мне (ссылку). Если посмотрите, то в этом указе есть "документ, подтверждающий проживание ребенка на территории Российской Федерации..." именно с этим и вопрос.