Квартира в собственности менее трёх лет. Хотим продать и приобрести квартиру в два раза дороже. Нужно ли будет платить налог?

Да, надо заплатить налог 13% от стоимости квартиры, квартира в собственности менее 3 х лет.

Минимальный срок владения объектом недвижимого имущества для получения освобождения от налогообложения дохода от его продажи, вообще-то, составляет 5 лет (ст.217.1 Налогового кодекса РФ). Три года только для определенных вариантов получения этой недвижимости в собственность. В Вашем случае ключевой вопрос не в этом, поскольку у Вас срок владения меньше трех лет. Вы вправе уменьшить сумму своего дохода от продажи квартиры на сумму фактически произведенных и документально подтвержденных расходов, связанных с ее приобретением (п.2 ч.2 ст.220 Налогового кодекса РФ). Говоря проще, квартира была куплена за 1 млн., продаете за 1 млн.-налога нет. Продаете за 1 млн. 500 тыс., платите налог с 500 тысяч. (вариант не подойдет в случае безвозмездного приобретения квартиры - подарок, наследство). Либо вы можете применить налоговый вычет в размере 1 млн. руб. (п.1 ч.2 ст.220 Налогового кодекса РФ), то есть продали за 1 млн. - нет налога, продали за 1 млн. 500 тыс. налог с 500 тыс. (Цифры конечно условные).

Нужно будет платить, так как что вы затем покупаете значения не имеет.

Вернее, при покупке жилья, если ранее вы не пользовались налоговым вычетом при покупках и имеете место работы с удержанием налога на доходы, то можно сделать зачет каждому с 2 млн рублей.