И ссылка на то, что в то время когда была куплена эта квартира, она (жена) работала будет не принята.

Уважаемый Александр! До 1 января 2001 г. вычет по суммам, направленным физическими лицами на новое строительство либо приобретение жилого дома, или квартиры, или дачи, или садового домика на территории Российской Федерации, предоставлялся в соответствии с пп."в" п.6 ст.3 Закона РФ от 07.12.1991 № 1998-1 "О подоходном налоге с физических лиц". Следует напомнить, что совокупный доход, полученный физическими лицами в налогооблагаемом периоде, уменьшался на суммы, направленные этими физическими лицами, являющимися застройщиками либо покупателями, на новое строительство либо приобретение жилого дома, или квартиры, или дачи, или садового домика на территории Российской Федерации, в пределах пятитысячекратного размера установленной законом минимальной месячной оплаты труда, учитываемой за три года (417 450 руб.). Эти суммы не могли также превышать размер совокупного дохода физических лиц за указанный период. Налогоплательщики, начавшие пользоваться налоговой льготой (Ваша жена не начинала пользоваться льготой) на основании данного Закона и не полностью ею воспользовавшиеся до 1 января 2001 г., на условиях, предусмотренных названным Законом, имеют право на предоставление имущественного налогового вычета по этому же объекту (квартире или жилому дому) в порядке, установленном пп.2 п.1 ст.220 НК РФ, с зачетом суммы расходов по строительству (приобретению) квартиры или жилого дома, ранее отнесенных на уменьшение совокупного дохода такого налогоплательщика.

Теперь имущественный налоговый вычет при покупке квартиры по заявлению налогоплательщика вместе с подачей декларации по подоходному налогу предоставляется налоговой инспекцией после регистрации права собственности на неё (в этом году возможно по новому строительству после получения разрешения налоговой инспекции получать вычет по месту работы, то есть не платить текущий подоходный налог до регистрации права собственности на квартиру после заключения и оплаты договора долевого участия в жилищном строительстве) в соответствии с пп.2 п.1 ст.220 НК РФ единожды и связан в таком случае с возвратом предварительно уплаченного подоходного налога. Однако получить возврат налога можно только в том случае, если заявление на вычет и декларация поданы за период не ранее, чем последние три года (п.8 ст.78 НК РФ), хотя максимальный размер вычета изменился(1000000руб.) и период возможного пользования вычетом от момента его предоставления и до получения возврата подоходного налога сроком не ограничен. Таким образом в 2005г. можно получить вычет за предыдущие три года, а за 1997г-2001г. вычет получить нельзя, прошёл срок давности. Если жена определённый период не работала, других налогооблагаемых доходов (например, от сдачи в аренду жилья) не имела и подоходный налог не платила, то и возвращать ей нечего. Правом на вычет жена сможет воспользоваться при покупке другой квартиры, либо при условии продажи указанной квартиры и повторной её покупки.