Проблемы с призывом на службу по контракту из-за погашенной судимости

Помогите разобраться со сложившейся ситуацией! В июне 2004 года был призван на срочную службу Красноармейским РВК в ПООН г.Железноводска Ставропольского края. Прослужив год я заключил контракт 17 мая 2005 года на прохождение военной службы в в/ч 3810 г.Железноводска в этом же отряде в Отдельной группе Специальной Разведки на должности разведчика-снайпера. Хотел перевестись в другую войсковую часть находящуюся в г.Новороссийске и договорившись с командиром подразделения убыл в другой город на свой страх и риск в ноябре 2005 г. В этот же период была проверка в части и на этот момент не обнаружили меня на службе. Никто об этом меня не известил, командир прикрыл себя сам, на период следствия был прикомандирован к другой войсковой части где числился тоже военнослужащим контрактной службы но в наряды не ходил и денежное довольствие не получал. 19 января 2007 года был осужден военным гарнизонным судом г Новороссийска по статья 337 часть 4 к 2 годам колонии-поселения но был условно-досрочно освобожден 10 июня 2008 г. Согласно ст.86 УК РФ и поправкам к этой статье судимость снята и погашена ещё 10 июня 2011 г справка из Центрального УВД имеется. Судимость погашена и снята а значит какие либо правовые отклонения уже в прошлом и я нормальный гражданин. Военно-учетная специальность востребована Разведчик-снайпер пригодность категории первая-А принимал участие во многих командировках и военно-спортивной экспедиции по подъёму на Эльбрус. Получил письмо из Министерства Обороны с гербом, исходящим номером и подписью начальника 4 управления Главного управления Е.Кучинского где говорится что в соответствии с пунктом 3 статьи 4 Положения снятая и или погашенная судимость не является основанием для отказа кандидату, поступающему на военную службу по контракту, в заключении с ним соответствующего контракта. Получил отношение для прохождения военной службы по контракту с в/ч 61576 на должности старшего разведчика развед. Взвода. Физическую подготовку сдал, прошел Военно-врачебную комиссию по месту жительства и присвоена категория годности-А. Был направлен в Краевой Военкомат для прохождения Военно-врачебной комиссии где тоже была поставлена категория годности-А. Но отказали в подаче рапорта о заключении контракта, обосновывая тем что получена негласная команда вышестоящего командования не призывать на службу по контракту лиц с погашенной или снятой судимостью. А письмо с положительным ответом из Министерства Обороны не берут во внимание. Обращаться в суд не хочется так как не желаю продолжать службу со скандала да и в военкомате пригрозили что найдут потом миллион причин чтобы побыстрей уволить.