Совпадение даты в счет-фактуре и чеке - необходимо для принятия налоговым органом НДС к вычету

Должна принять, чтобы подстраховаться напишите объяснительную, когда будуте заявлеть НДС к возмещению, что сначала Вы оформили с контрагентом акт выполненых работ и счет фактуру, а затем по факту оплатили позднее и в чем была причина такой задержки.

если у ИФНС возникнут какие-то сомнения они могут провести встречную проверку, запросив документы у контрагента.

Счет-фактура и чек могут иметь разную дату, т.к. договором может быть предусмотрена оплата через определенное время.

Однако отражение доходов/расходов и уплаты/вычета НДС в бухгалтерской отчетности (отчетный период) зависит от учетной политики на Вашем предприятии - учет по дате оплаты или по дате поступления документа (счет-фактуры).

Если учет производится по дате поступления документа, то налоговая обязана принять учет счет-фактуры в том квартале, в котором она выписана и зачесть НДС независимо от Вашей оплаты за услугу.

Если учет производится по дате оплаты, то учет таких расходов (и НДС) производится в том квартале, когда оплачены деньги.

Чаще всего организации учитывают НДС по дате поступления/создания документа (т.е. по документам), а доходы/расходы - по поступлении оплаты (т.е. по банку/кассе).

В таких случаях могут возникать расхождения в бухгалтерской отчетности по НДС и налогу на прибыль, которые признаются налоговыми органами допустимыми при наличии бухгалтерской справки о разных методах расчета налогов.