Подскажите, как мне поступать далее, ведь исковые сроки уже подходят.

Уважаемый Андрей, Вы можете подать исковое заявление по месту нахождения филиала или представительства данной организации (п.2ст.29 ГПК РФ), к исковому заявлению обязательно представьте документ, который доказывает, что в вашем городе существует филиал, он у Вас уже есть, как видно из Вашего письма. После чего Вам нужно написать заявление об оспаривании решений и действий( бездействия) огранов государственной власти, в данном случае гос.инспекции, а также должностных лиц ( гл.23 ГПК РФ). Судья обязан принять Ваше заявление, но при правильном оформлении документов. А за представление ложной информации гос.инспектором может последовать и уголовная ответственность, Все противоправные действия инспектора изложите в Вашем заявлении.

Уважаемый Андрей!

Поскольку Вы являетесь предпринимателем, и оспариваете решение представителя органа гос.власти, то дело в силу ст. 2 АПК РФ должно рассматриваться в арбитражном суде по месту нахождения ответчика.

В силу ст. 197 АПК производство по делу возбуждается на основании Заявления. Вам необходимо руководствоваться главой 24 АПК РФ, а также общими правилами искового производства в арбитражных судах (гл II АПК РФ) с особенностями, установленными гл. 24 АПК РФ.

В какой суд обратиться...Вам необходимо выяснить является ли инспекция, к которой Вы имеете претензии юридическим лицом или нет, т.к. ответчиком может быть только юридическое лицо (филиалы самостоятельными юр. лицами не являются). Кроме того, следует отметить, что существенно отличается порядок подачи заявлений в арбитражных судах и судах общей юрисдикции. В арб. суде: 1) необходимо самостоятельно отправлять копии заявления участникам дела заказным письмом с уведомлением, 2) квитанции об отправке копий участникам прилагать сразу к заявлению, а также прилагается платежное поручение об оплате госпошлины с оригинальной отметкой и круглой печатью банка, 3) другое исчисление и размер госпошлины, 4) В арбитражном суде - если надлежащим образом извещенный участник не явился в суд, это не является препятствием для рассмотрения дела. Истец также вправе известить суд о рассмотрении дела в его отсутствие, но иногда конечно от этого зависит исход дела....

И в заключении - первой инстанцией арбитражного суда является арбитражный суд соответствующего субъекта РФ.