Судебная коллизия - Признание не подписанных документов о пролонгации договора по электронной почте и его последствия

Между юридическими лицами (Заказчик и Исполнитель) был заключен подрядный договор. Договор закончился 31.12. 2013 осталась задолженность Исполнителя перед Заказчиком. В июне 2014 договор был продлен и подписано новое соглашение регулирующее виды работ по электронной почте. До ноября 2014 Заказчик ничего не сделал по договору и обратился в суд о возврате денежных средств. Но в договоре предусмотрена неустойка за не выполнение условий договору. С тем чтобы не платить неустойку по договору Заказчик в суде отрицает подписание приложения на пролонгацию и приложения регулирующие отношения сторон в новом сезоне. Если в судебном процессе будет принято решение о признании не подписанными документов о пролонгации договора по электронной почте то возникает следующая судебная коллизия: договором подписанным в 2013 году были также предусмотрены штрафные санкции за не выполнение объемов по договору. Заказчик частично их оплатил, в оставшейся части в октябре 2013 было подписано приложение приостанавливающее действие пункта по санкциям до подписания нового приложения. Данный документа также был подписан только по электронной почте. Если суд признает своим решением не легитимность подписанных по электронной почте документов, возможно ли признать не подписанным и приложение от октября 2013 приостанавливающее действие пункта по санкциям. Это приложение в данном суде не оспаривалось, но если его оспорить то возможно начисление санкций за период когда договор действовал, т.е. за не оспариваемый период. И возможно ли начать процесс по признанию не подписанным приложение от октября 2013 приостанавливающее действие пункта по санкциям в данном судебном процессе который еще не окончен или нужно дожидаться вступившего в силу решения суда о признании не подписанными документов о пролонгации договора по электронной почте?