Несколько лет назад сделали перепланировку с письменного разрешения владельца этого общежития.

В соответствии с «Временным положением об условиях и порядке перевода общежитий в статус жилых домов для постоянного проживания», утверждённым приказом Комитета по содержанию жилищного фонда и Комитета по жилищной политике Администрации Санкт-Петербурга от 07.03.2001 № 49/6 (ред. от 20.10.2003) определяются условия и порядок перевода общежитий в статус жилых домов для постоянного проживания независимо от принадлежности строений. Техническую возможность перевода жилых помещений общежитий в квартиры для постоянного проживания, с последующим изменением статуса общежитий рассматривают действующие районные межведомственные комиссии с участием представителя владельца общежития или организации, осуществляющей техническое обслуживание и ремонт здания общежития.

Из текста вопроса нельзя сделать вывод о том, какая площадь в общежитии была Вам предоставлена по ордеру или договору найма специализированного жилищного фонда, была ли перепланировка сделана за счёт предоставленной Вам площади, внесены ли изменения в технический паспорт или перепланировка сделана без надлежащего утверждения, какой метраж Вы оплачивали. Если в квартире, входящей в состав общежития квартирного типа имеется свободная изолированная комната, которая не занята, то она может быть предоставлена Департаментом, в ведении которого находится общежитие. Жилая площадь в общежитии предоставляется в размере не менее 6 кв. метров на одного человека. Семьям предоставляются изолированные жилые помещения (см. Постановление Совмина РСФСР от 11.08.1988 № 328 в ред. от 23.07.1993г. "Об утверждении примерного положения об общежитиях", ст.105 ЖК РФ). Если Вы оплачиваете проживание во всей квартире, то выселить Вас можно только в судебном порядке при наличии оснований. Вам нужно с документами(включая полученное письмо) обратиться за очной консультацией, чтобы оценить перспективу Вашей ситуации.