Может ли специалист по неврологии принять участие в программе земский доктор без интернатуры?

Поскольку определены требования к образованию - наличие у медицинского работника высшего профессионального образования и диплома об окончании интернатуры или ординатуры, то Ваша жена отвечает этим критериям. Ведь у неё есть документ об окончании интернатуры.

прошла первичную специализацию по неврологии

Она прошла не первичную специализацию, а профессиональную переподготовку и приобрела право на работу по новой специализации "Неврология".

В соответствии с пп. 1 п. 1 ст. 100 Федерального закона N 323-ФЗ "Об основах охраны здоровья граждан в Российской Федерации", право на осуществление медицинской деятельности в Российской Федерации имеют лица, получившие высшее или среднее медицинское образование в Российской Федерации в соответствии с федеральными государственными образовательными стандартами и имеющие сертификат специалиста.

Сертификат специалиста выдается после успешной сдачи экзамена по окончании обучения по основным профессиональным образовательным программам послевузовского профессионального образования (интернатура, ординатура, аспирантура, докторантура) либо после обучения по дополнительным профессиональным образовательным программам медицинского или фармацевтического образования (повышение квалификации, профессиональная переподготовка).

Ваша жена имеет сертификат и отвечает кретериям, предъявляемым к специалистам, участвующим в указанной программе. Вопросов по её квалификации не должно возникать.

Супруга получила отказ в минздраве Калужской области именно по причине отсутствия интернатуры по неврологии, причём после профпереподготовки она работает уже почти 15 лет и никого не смущало отсутствие интернатуры по неврологии (ни работодателей, ни при прохождении сертификационных циклов). И вдруг, как гром среди ясного неба, департамент отказал ей в приёме документов на участие в программе "земский доктор" по этой причине. Что ей делать дальше?