Как удалить нашу организацию из раздела \'Должники\' банкротного дела после оспаривания сделок с контрагентом?

Если в отношении Вашей организации не введена процедура банкротства, то Вы и не можете быть должниками на сайте. Обратитесь в арбитражный суд, который ведет дело о банкротстве Вашего контрагента с заявлением о б изменениях.

Федеральный закон от 26.10.2002 N 127-ФЗ (ред. от 18.06.2017) "О несостоятельности (банкротстве)" (с изм. и доп., вступ. В силу с 01.07.2017)

""Статья 2. Основные понятия, используемые в настоящем Федеральном законе

Для целей настоящего Федерального закона используются следующие основные понятия:

""несостоятельность (банкротство) (далее также - банкротство) - признанная арбитражным судом неспособность должника в полном объеме удовлетворить требования кредиторов по денежным обязательствам, о выплате выходных пособий и (или) об оплате труда лиц, работающих или работавших по трудовому договору, и (или) исполнить обязанность по уплате обязательных платежей;

""должник - гражданин, в том числе индивидуальный предприниматель, или юридическое лицо, оказавшиеся неспособными удовлетворить требования кредиторов по денежным обязательствам, о выплате выходных пособий и (или) об оплате труда лиц, работающих или работавших по трудовому договору, и (или) исполнить обязанность по уплате обязательных платежей в течение срока, установленного настоящим Федеральным законом;

Если есть удебные акты о задолженности Вашей организации перед банкротом, то она так и будет числится в таком виде во всех реестра. Вы просто можете работать с квалифицированным юристсом. Арбитражный/финансовый управляющий Виталий Снытко.