Почему нужно делать по 2 свидетельства на наследуемый объект недвижимости?

Вообще, госпошлина рассчитывается не по количеству свидетельств о праве на наследство, а исходя из общей стоимости наследственного имущества. Можно выписать хоть одно свидетельство, хоть несколько. От этого госпошлина не должна меняться.

НК РФ Статья 333.24. Размеры государственной пошлины за совершение нотариальных действий

1. За совершение нотариальных действий нотариусами государственных нотариальных контор и (или) должностными лицами органов исполнительной власти, органов местного самоуправления, уполномоченными в соответствии с законодательными актами Российской Федерации и (или) законодательными актами субъектов Российской Федерации на совершение нотариальных действий, государственная пошлина уплачивается в следующих размерах:

22) за выдачу свидетельства о праве на наследство по закону и по завещанию:

детям, в том числе усыновленным, супругу, родителям, полнородным братьям и сестрам наследодателя - 0,3 процента стоимости наследуемого имущества, но не более 100 000 рублей;

другим наследникам - 0,6 процента стоимости наследуемого имущества, но не более 1 000 000 рублей;

Ольга,

В соответствии с действующим законодательством:

ГК РФ

Статья 1162. Свидетельство о праве на наследство

...

Свидетельство выдается по заявлению наследника. По желанию наследников свидетельство может быть выдано всем наследникам вместе или каждому наследнику в отдельности, на все наследственное имущество в целом или на его отдельные части.

Нотариус, разумеется, действует по принципу, чем больше, тем лучше.

Вы можете разъяснить ему, что он, мягко говоря, не совсем прав. Если не поймет - напишите жалобу в нотариальную палату.