Кто может отказать в согласовании газификации СНТ, если договор уже заключен?

Не может. Вы собственник своего участка и вправе провести газ к своему дому. Ничьих прав вы при этом не нарушаете.

Cтатус владельца частного газопровода (так называемый «основной абонент») определен Правилами подключения (технологического присоединения) объектов капитального строительства к сетям газораспределения, утвержденными Постановлением Правительства РФ от 30.12.2013 N 1314, а именно пунктом 2 этих Правил:.

«основной абонент» — юридическое или физическое лицо, которое не оказывает услуги по транспортировке газа, владеющее на праве собственности или на ином законном основании объектом сети газораспределения и (или) газопотребления;

Важно, что фактическое присоединение при этом должно быть именно к сетям основного абонента:

«фактическое присоединение» — комплекс технических мероприятий, обеспечивающих физическое соединение (контакт) сети газораспределения исполнителя или сети газораспределения и (или) сети газопотребления основного абонента с сетью газопотребления объекта капитального строительства заявителя с осуществлением пуска газа в газоиспользующее оборудование заявителя, а в случае присоединения объекта сети газораспределения к другой сети газораспределения — в сеть газораспределения заявителя.

То есть СНТ в данной терминологии не является основным абонентом, т.к. вы присоединились не к его сетям.

Согласие нужно получать именно у основного абонента, то есть лица в собственности, которого находится труба.