Законно ли выговаривать за не прибытие на инструктаж суточного наряда и при уважительной причине?

Законно. Ваша обязанность прибыть на инструктаж.

Можете подать жалобу разберутся

Пишите жалобу.

Добрый день, Андрей! Из текста вопроса могу предположить, что вы военнослужащий. Прежде чем объявляется взыскание, проводится служебное разбирательство (ст. 28.1 - 28.10 ФЗ "О статусе военнослужащих"). Подробно изложено в ст. 47 Дисциплинарного устава ВС РФ, согласно которой Военнослужащие привлекаются к дисциплинарной ответственности за дисциплинарный проступок, то есть противоправное, виновное действие (бездействие), выражающееся в нарушении воинской дисциплины, который в соответствии с законодательством Российской Федерации не влечет за собой уголовной или административной ответственности.

За административные правонарушения военнослужащие несут дисциплинарную ответственность в соответствии с настоящим Уставом, за исключением административных правонарушений, за которые они несут ответственность на общих основаниях. При этом к военнослужащим не могут быть применены административные наказания в виде административного ареста, исправительных работ, а к сержантам, старшинам, солдатам и матросам, проходящим военную службу по призыву, к курсантам военных образовательных организаций до заключения с ними контракта о прохождении военной службы также в виде административного штрафа.

Военнослужащий привлекается к дисциплинарной ответственности только за тот дисциплинарный проступок, в отношении которого установлена его вина.

Виновным в совершении дисциплинарного проступка признается военнослужащий, совершивший противоправное действие (бездействие) умышленно или по неосторожности.

Вина военнослужащего, привлекаемого к дисциплинарной ответственности, должна быть доказана в порядке, определенном федеральными законами, и установлена решением командира (начальника) или вступившим в законную силу постановлением судьи военного суда.

Привлечение военнослужащего к дисциплинарной ответственности не освобождает его от исполнения обязанности, за неисполнение которой дисциплинарное взыскание было применено.

Обстоятельства, смягчающие, отягчающие дисциплинарную ответственность и исключающие ее, а также учитываемые при назначении дисциплинарного взыскания, определяются Федеральным законом "О статусе военнослужащих".

Из ваших пояснений видно, что указанная процедура не соблюдена, есть перспектива побороться.

У меня опыт военной службы 27 лет, юрстаж 20 лет, в./зв. подполковник юстиции запаса, обращайтесь, постараюсь вам помочь