Подскажите пожалуйста, что мне делать в данной ситуации и руководствоваться чьим приказом в данной ситуации?

Запросите официальные документы

В военкомате:

Получите письменные повестки с датами и временем обследований.

Попросите справку о явке после каждого посещения.

В МВД:

Запросите копию приказа о прохождении практики, где указаны ваши обязанности и график.

Уведомите руководство практики:

Напишите заявление на имя куратора практики:

«В связи с необходимостью прохождения медицинского обследования по направлению военного комиссариата [название] прошу предоставить мне возможность отсутствовать на практике в период с [дата] по [дата]. К заявлению прилагаю копии повесток и справок из военкомата».

Согласуйте график:

Предложите отработать пропущенные часы в другое время (например, вечером или в выходные).

Если МВД отказывает, обратитесь в чебный отдел вашего вуза/колледжа — они могут повлиять на организацию практики.

Если МВД настаивает на нарушениях:

Подайте письменное обращение в отдел кадров МВД с просьбой разъяснить, какой именно пункт приказа вы нарушаете.

Ссылайтесь на ст. 219 ТК РФ

Если военкомат выражает несогласие:

Сообщите военкомату, что МВД препятствует явке, и запросите перенос сроков обследования.

Предоставьте в военкомат письменный отказ МВД (если есть) — это будет уважительной причиной для переноса.

МВД должны пойти на встречу т.к. требования военкомата в приоритете.

Если вы являетесь студентом обучающимся по очной программе, у вас имеется отсрочка от призыва на военную службу. В период действия отсрочки от призыва на военную службу военный комиссариат не может вызывать вас на какие либо мероприятия связанные с работой призывной комиссии. Военно-врачебная комиссии относится именно к таким мероприятиям, следовательно требования военного комиссариата неправомерны и привлечь вас к ответственности они не могут (абз. 5, п. 7 Положения о призыве на военную службу граждан Российской Федерации "Оповещение призывников осуществляется на протяжении всего периода подготовки и проведения мероприятий, связанных с призывом на военную службу. Вызову на медицинское освидетельствование и заседание призывной комиссии подлежат все призывники, кроме имеющих отсрочку от призыва.")