Можно ли заключить договор купли-продажи комнаты, когда в комнате еще прописаны жильцы?

чья либо прописка не является препятствием для совершения сделки

Только внимательно смотрите, чтобы это не были лица: недееспособные, несовершеннолетние, находящиеся под опекой, а также лица, ранее проживавшие в данном помещении, но отказавшиеся от приватизации.

В первых двух случаях сделка будет недействительной, в последнем - вы получите комнаты с жильцом, который имеет пожизненное права пользования квартирой.

Следует к этому отнестись с предосторожностью и проверить основания их вселения. Существенным условием договора продажи жилого дома, квартиры, части жилого дома или квартиры, в которых проживают лица, сохраняющие в соответствии с законом право пользования этим жилым помещением после его приобретения покупателем, является перечень этих лиц с указанием их прав на пользование продаваемым жилым помещением.

В качестве таких лиц могут выступать: арендаторы (п. 2 ст. 671 ГК); наниматели и постоянно проживающие с ними граждане (ст. 675, 677 ГК); получатели ренты, проживающие в отчужденном по рентному договору жилом помещении (п. 1 ст. 586 ГК); отказополучатели, проживающие в жилом помещении в силу завещательного отказа (ст. 1137 ГК); бывшие члены семьи собственника приватизированного жилого помещения (ст. 19 Федерального закона от 29 декабря 2004 г. "О введении в действие Жилищного кодекса Российской Федерации" (СЗ РФ. 2005. N 1 (ч. I). Ст. 15), см. также п. 18 Постановления ВС N 14). О правовом положении иных (в том числе бывших) членов семьи собственника см. п. 2 ст. 292 ГК, ст. 31 ЖК, пп. 11, 13-14, 19 Постановления ВС N 14.В связи с существенным характером данного условия следует признать, что оно должно быть согласовано независимо от того, существуют ли подобные лица или нет. В последнем случае в договоре должно содержаться положение о том, что лица, сохраняющие право пользования им после перехода права собственности к покупателю, отсутствуют.