Как мы должны поступить с вновь принятой сотрудницей в случае выхода первой из отпуска по уходу за ребенком.

Не овсем ясно, что вы имели ввиду, что в договоре это отражено. Вообще вы должны были принять работника по срочному трудовому договору, согласно ст. п. 1 Ст. 59 ТК РФ - Срочный трудовой договор заключается:

на время исполнения обязанностей отсутствующего работника, за которым в соответствии с трудовым законодательством и иными нормативными правовыми актами, содержащими нормы трудового права, коллективным договором, соглашениями, локальными нормативными актами, трудовым договором сохраняется место работы.

В случае наступлении беременности работника, работающего по срочному трудовому договору, следует действовать согласно ст. 261 ТК РФ, а именно часть 2 и 3

В случае истечения срочного трудового договора в период беременности женщины работодатель обязан по ее письменному заявлению и при предоставлении медицинской справки, подтверждающей состояние беременности, продлить срок действия трудового договора до окончания беременности. Женщина, срок действия трудового договора с которой был продлен до окончания беременности, обязана по запросу работодателя, но не чаще чем один раз в три месяца, предоставлять медицинскую справку, подтверждающую состояние беременности. Если при этом женщина фактически продолжает работать после окончания беременности, то работодатель имеет право расторгнуть трудовой договор с ней в связи с истечением срока его действия в течение недели со дня, когда работодатель узнал или должен был узнать о факте окончания беременности.

Допускается увольнение женщины в связи с истечением срока трудового договора в период ее беременности, если трудовой договор был заключен на время исполнения обязанностей отсутствующего работника и невозможно с письменного согласия женщины перевести ее до окончания беременности на другую имеющуюся у работодателя работу (как вакантную должность или работу, соответствующую квалификации женщины, так и вакантную нижестоящую должность или нижеоплачиваемую работу), которую женщина может выполнять с учетом ее состояния здоровья. При этом работодатель обязан предлагать ей все отвечающие указанным требованиям вакансии, имеющиеся у него в данной местности. Предлагать вакансии в других местностях работодатель обязан, если это предусмотрено коллективным договором, соглашениями, трудовым договором.

В срочном трудовом договоре Вы указали, что он действует на период отсутствия работника по причине ухода за ребенком до 1,5 (или 3-х) лет беременности и родам. Следовательно, когда постоянный работник пожелает выйти на работу с отпуска по уходу за ребенком (а по закону он может это сделать в любое время) или по окончанию отпуска по уходу за ребенком, срочный трудовой договор и будет расторнут.

Так как и с иным работником, принятым на место основного.