Развод родителей и спор о собственности - почему суд не учел выплаты матерью за квартиру?

Мои родители развелись в 1989 году. В период брака была приобретена 3 комнатная кооперативная квартира, однако около половины стоимости квартиры было выплачено мамой после развода (все квитанции на руках). Однако почему-то суд не учёл этот момент и признал за родителями 46/100 за отцом, хотя опять же повторюсь, что после развода мама платила лично около половины стоимости квартиры и окончила выплачивать примерно в 1992 году. Решение суда было в 2013 г., однако мы подавали апелляции, но решение суда было без изменений. Подскажите как такое может быть? Квартира кооперативная. Можно сроки вернуть по данному делу? Так как изначально наша сторона (мамина) придерживалась политики исковой давности. Первый суд прошёл в нашу пользу, но потом отец подал апелляцию, дело перенаправили другому судье и всё, нам постоянно отказывали. Отец подал на раздел квартиры в 2010 г. Право собственности было оформлено мамой в 2008 году. Из нашей семьи отец ушёл в 1989 году и никакой помощи никому не оказывал. А теперь выписал дарственную на свою дочь от второго брака, которая требует своей доли. Угрожает продать её лицам кавказской национальности. Или в банк отдать. Либо предлагает нам её долю выкупить, но за нереальные деньги. В данной квартире отец не появлялся с момента ухода в другую семью (1989 г.), мы сделали небольшой ремонт и т.п. В ней проживаем я, мама, сестра и её малолетний ребёнок.