Знаю, что вычет не применяется в случае ее совершения между взаимозависимыми физическими лицами.

Уважаемая Ольга! Налоговый орган вправе предоставить имущественный налоговый вычет, предусмотренный подп. 2 п. 1 ст. 220 НК, физическим лицам, состоящим в соответствии с семейным законодательством РФ в брачных отношениях, отношениях родства или свойства, усыновителя или усыновленного, а также попечителя и опекаемого, т.е. признаваемым в соответствии с п. 1 ст. 20 НК взаимозависимыми лицами, если отношения между этими лицами не оказали влияние на условия и экономические результаты заключенной между ними сделки купли-продажи жилого дома, квартиры или доли (долей).

Если же отношения между вышеуказанными лицами оказали влияние на условия и экономические результаты заключенной между ними сделки купли-продажи жилого дома, квартиры или доли (долей) (например, цена сделки существенно отклоняется от среднерыночной цены или продавец сохраняет за собой право пользования жильем, являющимся предметом сделки), то в таких случаях возникают основания для признания в судебном порядке лиц, участвующих в сделке, взаимозависимыми по иным основаниям, не предусмотренным п. 1 ст. 20 НК.

При наличии судебного решения о признании участников таких сделок взаимозависимыми лицами имущественный налоговый вычет, предусмотренный подп. 2 п. 1 ст. 220 НК, не применяется(См. также: письмо ФНС России от 21.09.2005 N 04-2-02/378@).

Вы должны по дать декларацию по форме №3-НДФЛ, заявление на выче и документы по покупке и подать в налоговую инспекцию по месту жительства. При получении акта камерельной проверки нужно подать возражение. Постановление об отказе обжалуется апелляционной жалобой в вышестящую налоговую, а потом в суд.