Неужели одновременно преобразовать юр. лицо и увеличить уставник нельзя?

Это произвол налогового органа. Обжалуйте действия налогового органа в арбитражном суде в порядке главы 24 Арбитражного процессуального кодекса, а затем, в порядке статьи 1069 ГК РФ, возместите все убытки, вызванные произволом.

Основание:

ГК РФ. Статья 57. Реорганизация юридического лица

1. Реорганизация юридического лица (слияние, присоединение,

разделение, выделение, преобразование) может быть осуществлена по

решению его учредителей (участников) либо органа юридического

лица, уполномоченного на то учредительными документами.

3. В случаях, установленных законом, реорганизация юридических

лиц в форме слияния, присоединения или преобразования может быть

осуществлена лишь с согласия уполномоченных государственных

органов.

ФЕДЕРАЛЬНЫЙ ЗАКОН

ОБ ОБЩЕСТВАХ С ОГРАНИЧЕННОЙ ОТВЕТСТВЕННОСТЬЮ

Статья 51. Реорганизация общества

1. Общество может быть добровольно реорганизовано в порядке,

предусмотренном настоящим Федеральным законом.

Другие основания и порядок реорганизации общества определяются

Гражданским кодексом Российской Федерации и иными федеральными

законами.

2. Реорганизация общества может быть осуществлена в форме

слияния, присоединения, разделения, выделения и преобразования.

3. Общество считается реорганизованным, за исключением случаев

реорганизации в форме присоединения, с момента государственной

регистрации юридических лиц, создаваемых в результате

реорганизации.

4. Государственная регистрация обществ, созданных в результате

реорганизации, и внесение записей о прекращении деятельности

реорганизованных обществ, а также государственная регистрация

изменений в уставе осуществляется в порядке, установленном

федеральными законами.

5. Не позднее тридцати дней с даты принятия решения о

реорганизации общества, а при реорганизации общества в форме

слияния или присоединения с даты принятия решения об этом

последним из обществ, участвующих в слиянии или присоединении,

общество обязано письменно уведомить об этом всех известных ему

кредиторов общества и опубликовать в органе печати, в котором

публикуются данные о государственной регистрации юридических лиц,

сообщение о принятом решении. При этом кредиторы общества в

течение тридцати дней с даты направления им уведомлений или в

течение тридцати дней с даты опубликования сообщения о принятом

решении вправе письменно потребовать досрочного прекращения или

исполнения соответствующих обязательств общества и возмещения им

убытков.

Государственная регистрация обществ, созданных в результате

реорганизации, и внесение записей о прекращении деятельности

реорганизованных обществ осуществляются только при представлении

доказательств уведомления кредиторов в порядке, установленном

настоящим пунктом.

Статья 56. Преобразование общества

1. Общество вправе преобразоваться в акционерное общество,

общество с дополнительной ответственностью или производственный

кооператив.

2. Общее собрание участников общества, реорганизуемого в форме

преобразования, принимает решение о такой реорганизации, о порядке

и об условиях преобразования, о порядке обмена долей участников

общества на акции акционерного общества, доли участников общества

с дополнительной ответственностью или паи членов производственного

кооператива, об утверждении устава создаваемого в результате

преобразования акционерного общества, общества с дополнительной

ответственностью или производственного кооператива, а также об

утверждении передаточного акта.

3. Участники юридического лица, создаваемого в результате

преобразования, принимают решение об избрании его органов в

соответствии с требованиями федеральных законов о таких

юридических лицах и поручают соответствующему органу осуществить

действия, связанные с государственной регистрацией юридического

лица, создаваемого в результате преобразования.

4. При преобразовании общества к юридическому лицу, созданному

в результате преобразования, переходят все права и обязанности

реорганизованного общества в соответствии с передаточным актом.

ГК РФ. Статья 1069. Ответственность за вред, причиненный

государственными органами, органами местного самоуправления, а

также их должностными лицами

Вред, причиненный гражданину или юридическому лицу в

результате незаконных действий (бездействия) государственных

органов, органов местного самоуправления либо должностных лиц этих

органов, в том числе в результате издания не соответствующего

закону или иному правовому акту акта государственного органа или

органа местного самоуправления, подлежит возмещению. Вред

возмещается за счет соответственно казны Российской Федерации,

казны субъекта Российской Федерации или казны муниципального

образования.