Обвиняют в подделке кассового чека за проживание в гостинице - как доказать невиновность, если администратор отказывается подтвердить чек?

Вы не обязаны доказывать невиновность. Это следствие должно установить Вашу вину при наличии необходимых доказательств. Если Вы невиновны, их попросту не будет.

Здравствуйте.

Статья 140. Поводы и основание для возбуждения уголовного дела

[Уголовно-процессуальный кодекс РФ] [Глава 19] [Статья 140]

1. Поводами для возбуждения уголовного дела служат:

1) заявление о преступлении;

2) явка с повинной;

3) сообщение о совершенном или готовящемся преступлении, полученное из иных источников;

4) постановление прокурора о направлении соответствующих материалов в орган предварительного расследования для решения вопроса об уголовном преследовании.

1.1. Утратил силу.

1.2. Поводом для возбуждения уголовного дела о преступлениях, предусмотренных статьей 172.1 Уголовного кодекса Российской Федерации, служат только те материалы, которые направлены Центральным банком Российской Федерации в соответствии с Федеральным законом от 10 июля 2002 года N 86-ФЗ "О Центральном банке Российской Федерации (Банке России)", а также конкурсным управляющим (ликвидатором) финансовой организации для решения вопроса о возбуждении уголовного дела.

2. Основанием для возбуждения уголовного дела является наличие достаточных данных, указывающих на признаки преступления.

По ст. 327 УК РФ срок. Какие есть доказательства?

А проверка показала отсутствия указанного чека по их бухгалтерии. Но на чеке и накладной стоит их печать. Как доказать невиновность?

Вы не должны доказывать невиновность в силу принципа презумпции невиновности, пусть обращаются в полицию, если считают, что вы могли что-то украсть по поддельному чеку.