Он уехал обратно в свой город жить и работать, как можно без него отменить эту регистрацию?

К сожалению, Татьяна, никак. Для того, чтобы снять человека с учета по месту временного пребывания необходимо именно его согласие. Он должен добровольно об этом написать заявление в паспортный стол. И в принудительном порядке через суд этого сделать нельзя, поскольку в таком иске Вам откажут.

Должно быть уже вступило в полном объеме в силу постановление правительства РА №855 от 11 ноября 2010 г.,, а этим постановлением в пункт 30 Правил регистрации и снятия граждан РФ с регистрационного учета внесены изменения, в соответствии с которыми в вашем случае вы вправе подать в подразделение ФМС заявление в произвольной форме (но письменно) о снятии этого гражданина с регистрационного учета досрочно (в связи с его убытием к месту жительства).

Подаёте заявление с требованием снять с регистрации и приложить свидетельство.

Прошу прощения за некорректный ответ, основанный на законодательстве без изменений. Коллеги правы, с 01.01.2011 г. при досрочном убытии гражданина из жилого помещения, не являющегося его местом жительства, этот гражданин либо лицо, предоставившее ему жилое помещение для временного проживания, обращается с заявлением в произвольной форме о снятии его с регистрационного учета по месту пребывания с указанием даты убытия (если такая дата известна) либо направляет заявление почтовым отправлением или через Единый портал в орган регистрационного учета, который производил регистрацию по месту пребывания этого гражданина. Собственник или наниматель в случае получения уведомления о регистрации по месту пребывания гражданина, которому он не давал согласие на временное проживание, может подать заявление в произвольной форме об аннулировании этому гражданину регистрации по месту пребывания в орган регистрационного учета, который производил регистрацию по месту пребывания этого гражданина.